Der er en række måder, hvorpå døgn-ure kommunikerer med hinanden. En måde er gennem frigivelse af hormoner. For eksempel produceres hormonet melatonin af pinealkirtlen i hjernen og frigives om natten. Melatoninniveauet stiger om aftenen og falder om morgenen, hvilket hjælper med at regulere søvn-vågen-cyklusser.
En anden måde, hvorpå døgn-ure kommunikerer med hinanden, er gennem transmission af elektriske signaler. For eksempel sender SCN elektriske signaler til rygmarven, som derefter videresender signalerne til andre dele af kroppen. Disse signaler hjælper med at synkronisere aktiviteten af ure i forskellige dele af kroppen.
Endelig kan cirkadiske ure også kommunikere med hinanden gennem udveksling af metabolitter. For eksempel er molekylet adenosintrifosfat (ATP) en energikilde for celler og produceres af mitokondrierne. ATP-niveauer svinger i løbet af dagen, og disse udsving kan påvirke aktiviteten af cirkadiske ure.
Kommunikationen mellem døgn-ure er afgørende for at opretholde en konsistent intern rytme. Denne rytme hjælper os med at tilpasse os det skiftende miljø og til at bevare vores helbred.