Hvilket rige indeholder prokaryote organismer?

Det er dog vigtigt at bemærke, at klassificeringen af organismer i kongeriger er et noget forældet system. Moderne klassificeringssystemer, ligesom det tre-domænesystem, har erstattet det traditionelle fem-kingdomsystem. I det tre-domænesystem er prokaryoter opdelt i to domæner: bakterier og archaea .

Så selvom "Monera" stadig nogle gange bruges til at henvise til prokaryoter, er det mere nøjagtigt at sige, at prokaryoter hører til domænerne bakterier og archaea.