Mikrobølgeovnen bruger mikrobølger, en type elektromagnetisk (EM) stråling. Mikrobølger er en del af det større EM-spektrum, som også omfatter radiobølger, infrarød stråling, synligt lys, ultraviolet stråling og røntgenstråler. Mikrobølger har et bølgelængdeområde fra omkring 1 millimeter til 1 meter og et frekvensområde fra omkring 300 MHz til 300 GHz.