Coronavirus-testsæt skal udvikles ved hjælp af ny RNA-billeddannelsesteknologi

Simon Fraser University-forskere vil bruge deres banebrydende billedteknologi - kaldet Mango, for sin lyse farve - at udvikle coronavirus-testsæt. De er blandt et lille sæt canadiske forskere, der reagerede på den hurtige finansieringsmulighed, der for nylig blev annonceret af Canadian Institutes of Health Research (CIHR) for at hjælpe med at håndtere COVID-19.

SFU-forskere Lena Dolgosheina, en post-doc og Peter Unrau, professor i molekylærbiologi og biokemi, udviklet Mango til følsomt at detektere RNA-molekyler, hjælper med at forbedre viral screening for vira såsom coronavirus, samtidig med at det muliggør grundlæggende opdagelser i cellernes funktion.

Den seneste forskning, ledet af Unrau, involverer at bruge Mango til at detektere individuelle RNA-molekyler i en levende celle.

"Vi er lavet af molekyler, så når noget går galt i en celle, sker det på molekylært niveau, siger Unrau. "Vi bruger Mango-systemet som en katalysator, at give os mulighed for ikke kun at udvide grundlæggende forskningsspørgsmål, men også at opdage patogener som coronavirus, hurtigere og mere effektivt."

Mango-systemet består af en RNA Mango-aptamer, der binder tæt og specifikt til et fluorescerende farvestof. Aptameren fungerer som en magnet - målretter og binder disse farvestofmolekyler. Farvestoffet bliver exciterbart, når det bindes og lyser klart. RNA-molekyler modificeret til at indeholde aptamer-'magneten' skiller sig nu ud fra de andre dele af cellen, hvilket gør det meget lettere for forskere at se og studere RNA-molekyler under et mikroskop.

"Celleregulering finder sted på RNA-niveau, " siger han. "I lang tid, fokus har været på protein, men det er RNA og ikke protein, der regulerer langt de fleste processer i en celle."

RNA Mango farvestoffer er i øjeblikket tilgængelige fra Applied Biological Materials (ABM) i Richmond, B.C. Coronavirus-forskningen, der er muliggjort af CIHR-finansiering, vil give holdet mulighed for at udvikle en isotermisk testmetode, kendt som Mango NABSA (nukleinsyresekvens-baseret amplifikation).

Mango NABSA-sættene kan bruges til at teste for coronavirus, som er en positiv streng RNA-virus. ABM er aktivt involveret i dette projekt som partner og vil levere de nødvendige enzymer og buffere, som SFU-holdet oprindeligt udviklede.

"Mango-teknologi er topmoderne, og udviklingen af ​​effektive kure mod kræft og andre sygdomme kræver bedre billeddannelsesmetoder for hurtigt at lære, hvordan celler fungerer i detaljer, " tilføjer Unrau.

Holdets forskning er publiceret i Naturkommunikation .