Ny teknologi kan registrere hundredvis af proteiner i en enkelt prøve

Ny teknologi udviklet af et team af forskere ved McGill University viser potentiale til at strømline analysen af ​​proteiner, tilbyde en hurtig, stort volumen og omkostningseffektivt værktøj til både hospitaler og forskningslaboratorier.

Proteiner, der findes i blod, giver forskere og klinikere vigtige oplysninger om vores helbred. Disse biologiske markører kan afgøre, om brystsmerter er forårsaget af en hjertehændelse, eller om en patient har kræft.

Desværre, værktøjerne, der bruges til at opdage sådanne proteiner, har ikke udviklet sig meget i løbet af de sidste 50 år - på trods af at der er over 20, 000 proteiner i vores krop, langt de fleste proteintest, der køres i dag, er kun målrettet mod et enkelt protein ad gangen.

Nu, Ph.d. kandidat Milad Dagher, Professor David Juncker og kolleger i McGills afdeling for biomedicinsk teknik har udviklet en teknik, der kan detektere hundredvis af proteiner med en enkelt blodprøve.

En del af deres arbejde, netop udgivet i Naturnanoteknologi , beskriver en ny og forbedret måde at stregkode mikroperler ved hjælp af flerfarvede fluorescerende farvestoffer. Ved at generere op til 500 forskelligt farvede mikroperler, deres nye stregkodningsplatform muliggør detektion af markører parallelt fra den samme løsning - f.eks. en blå stregkode kan bruges til at registrere markør 1, mens en rød stregkode kan registrere markør 2, og så videre. Et laserbaseret instrument kaldet et cytometer tæller derefter de proteiner, der klæber til de forskellige farvede perler.

Selvom denne form for analysemetode har været tilgængelig i nogen tid, interferens blandt flerfarvede farvestoffer har begrænset evnen til at generere de rigtige farver. Nu, en ny algoritme udviklet af teamet gør det muligt at generere forskellige farver på mikroperler med høj nøjagtighed-ligesom et farvehjul kan bruges til at forudsige resultatet af farveblanding.

Professor Junckers team håber at kunne udnytte sin platform til forbedret analyse af proteiner.

"Nuværende teknologier har en stor afvejning mellem antallet af proteiner, der kan måles på én gang, og omkostningerne og nøjagtigheden af ​​en test ", Dagher forklarer. "Det betyder, at store undersøgelser, såsom kliniske forsøg, er undermagt, fordi de har en tendens til at falde tilbage på velprøvede platforme med begrænsede muligheder. "

Deres kommende arbejde fokuserer på at opretholde nøjagtig påvisning af proteiner med øget skala.

"Ensemble flerfarvet FRET -model muliggør stregkodning på ekstreme FRET -niveauer" af Milad Dagher, Michael Kleinman, Andy Ng og David Juncker blev offentliggjort i Naturnanoteknologi .