Her er en sammenbrud:
* methan: Metan absorberer rødt lys og reflekterer blåt lys, hvorfor Neptune ser ud til at være blå. De frosne metanpartikler danner skyer i højere højder, hvor temperaturerne er ekstremt lave.
* Hydrogensulfid: Denne forbindelse menes at være til stede i dybere skyer og bidrager til planetens samlede farve.
Mens dette er de primære komponenter, andre sporelementer som ammoniak (NH3) og vand (H2O) Kan også være til stede i de dybere lag af Neptunes atmosfære.
Det er vigtigt at huske, at vi ikke har direkte prøver af Neptunes atmosfære, så vores viden er baseret på observationer fra teleskoper og rumfartøjer.