25 arter afsløret for 25 Genomes Project

For at fejre Wellcome Trust Sanger Institute, der fylder 25 i 2018, Instituttet og dets samarbejdspartnere sekventerer 25 nye genomer af arter i Storbritannien. De sidste fem arter er nu blevet valgt af tusindvis af skolebørn og medlemmer af offentligheden over hele kloden, der deltog i 25 Genomes Project online-afstemningen.

Projektet kunne afsløre, hvorfor nogle havørreder migrerer til det åbne hav, mens andre ikke gør det, eller fortæl os mere om magnetoreceptorerne i Robins øjne, der gør det muligt for dem at 'se' Jordens magnetfelter. Det kunne også kaste lys over, hvorfor røde egern er sårbare over for egernkoppevirus, alligevel kan grå egern bære og sprede virussen uden at blive syge.

Alle resultaterne vil blive gjort offentligt tilgængelige og vil føre til fremtidige undersøgelser for at forstå biodiversiteten i Storbritannien og hjælpe med at bevare og forstå disse arter.

Sanger Institute blev grundlagt i 1993 af professor Sir John Sulston som en del af Human Genome Project. Instituttet ydede det største enkeltbidrag til guldstandardsekvensen af ​​det første menneskelige genom, som udkom i 2003.

Et genom er en organismes komplette sæt af genetiske instruktioner skrevet i DNA. Hvert genom indeholder al den information, der er nødvendig for at opbygge denne organisme og tillade den at vokse og udvikle sig.

Siden den skelsættende færdiggørelse af det menneskelige genom, Sanger Institute er blevet en globalt anerkendt leder inden for genomik. Mange flere vigtige referencegenomer er allerede blevet sekventeret - fra muse- og zebrafiskgenomerne til grisen, gorilla, myg og mange andre. Ud over dyrearter, infektionssygdomme og bakterier har også en fremtrædende plads på listen over referencegenomer, fra salmonella og MRSA til klamydia og malaria. Alle disse har givet vigtige indsigter om disse arter i sundhed og sygdom.

Nu, Sanger Institute og dets partnere sekventerer omfattende 25 arter fra Storbritannien. Dette projekt er et lille bidrag til en meget større virksomhed, hvor videnskabsmænd fra hele verden går sammen for at danne en plan for at sekvensere alt liv på Jorden.

Dette projekt er blevet muliggjort af PacBio® langlæst sekvenseringsteknologi, som genererer genomer af høj kvalitet. Instituttet samarbejder med PacBio og andre ledere i teknologisektoren, 10x Genomics og Illumina, at skabe det mest omfattende billede af disse genomer.

Genomerne af høj kvalitet vil åbne døre for, at forskere kan bruge denne information, og forskere kunne opdage, hvordan britiske arter reagerer på miljøbelastninger, og hvilke hemmeligheder de har i deres genetik, der sætter dem i stand til at blomstre, eller skrubber.

De 25 arter er opdelt i fem kategorier afhængigt af de egenskaber, de deler:Blomstrende, arter på vej op i Storbritannien; Skrubbe, truede og tilbagegående arter; Farligt, invasive og skadelige arter; Ikonisk, typisk britiske arter, som vi alle genkender; Kryptisk, arter, der er ude af syne eller ikke kan skelnes fra andre baseret på udseende alene.

De 25 arter, der vil få sekventeret deres genomer, er:

Blomstrende arter:

• Grå egern
• Ringlet sommerfugl
• Roesels Bush-Cricket
• Oxford Ragwort

Skrubbende arter:

• Rødt Egern
• Vandvolde
• Turteldue
• Nordlige februar rød stenflue

Farlige arter:

• Kæmpebjørneklo
• Indisk balsam
• Kong Kammusling, også kendt som stor kammusling, Coquilles Saint-Jacques
• New Zealand fladorm

Ikoniske arter:

• gylden ørn
• Brombær
• Europæisk Robin
• Red Mason Bee

Kryptiske arter:

• Brunørred
• Almindelig Pipistrelle Flagermus
• Carringtons fjerurt
• Sommer trøffel

Fem arter udvalgt af offentligheden:

• Almindelig Søstjerne
• Fen Raft Edderkop
• Mindre plettet kattehaj
• Asiatisk Hornet
• Eurasisk Otter

Professor Sir Mike Stratton, direktør for Wellcome Trust Sanger Institute, sagde:"Femogtyve år siden var feltet för genomik en spirende idé, og dets implikationer kun drømte om. I dag er virkeligheden med genomik og biodata, at det transformerer vores forståelse, diagnose, og behandling af sygdomme, lige fra kræft og hjertesygdomme til malaria og infektioner. Videnskaben og teknologien, der driver denne opdagelsesæra, accelererer vores forståelse af den menneskelige krop, men også af verden omkring os.

Dette projekt er kommet efter mange tankevækkende samtaler rundt om i verden med hensyn til, hvor mange af arterne på vores planet, der kunne sekventeres i de kommende årtier - i princippet, allesammen. Vi går i gang med vores bidrag til at sekventere alt liv på Jorden."

Dr. Julia Wilson, Associeret direktør for Wellcome Trust Sanger Institute, sagde:"Ved at sekventere disse 25 genomer, forskere vil få en bedre forståelse af britiske arter, hvordan de kom hertil, deres udvikling, og hvordan forskellige arter tilpasser sig et foranderligt miljø. Resultaterne kunne afsløre skjulte sandheder i disse arter, og vil gøre det muligt for det videnskabelige samfund at forstå, hvordan vores verden konstant ændrer sig og udvikler sig omkring os. Vi ønsker at fejre 25 års jubilæum for Sanger Instituttet på en særlig 'Sanger' måde, og jeg er spændt på at se, hvordan 25 Genomes Project udvikler sig."

Ken Skeldon, Head of Public Engagement på Wellcome Genome Campus, sagde:"At give offentligheden mulighed for at vælge, hvilke arter der skal have deres genomer sekventeret i 25 Genomes Project, har bragt nye perspektiver til projektet. Vi er glade for at se, at så mange mennesker og skolebørn i hele Storbritannien og videre har engageret sig aktivt i online chatter med forskerne og stemte på de sidste fem arter."

Tim Littlewood, Head of Life Sciences på Natural History Museum sagde:"Naturhistorisk Museum er stolt af at samarbejde med Sanger Institute for at fejre deres 25-års fødselsdag og også for at fejre de fremskridt, som molekylære teknikker såsom genomsekventering kan bringe til studiet af Storbritannien dyreliv. De 80 millioner eksemplarer, vi holder af, fra rundt om i verden, har et væld af genetisk information, der gør os i stand til at udføre innovativ forskning, håndtering af globale udfordringer. Et fokus på britisk biodiversitet med banebrydende teknologi er særlig velkommen."