Tab af Setdb1 i endoderm fører til stærke udviklingsdefekter under embryogenese. en lateral visning af kontrol og Setdb1 END embryoner ved E7.5 (sen knopstadium), E7.75 (hovedfoldningsstadium), E8.5 (~6 somit) og E9. Ingen synlige udviklingsfejl kan påvises i Setdb1 END embryoner fra E7.5 til E8.0. Setdb1 END embryoner viser en aksedrejningsdefekt, som manifesterer sig fra E8.5 og fører til kraftig posterior trunkering ved E9.0. Repræsentative billeder fra n = 3 pr. genotype og stadium. b Sidebillede af E7.5-kontrol og Setdb1 END embryoner farvet med Foxa2- og Sox17-antistoffer (fortil til venstre). Tilstedeværelsen af begge markører indikerer, at endodermceller kunne dannes i Setdb1 END embryoner. Repræsentative billeder fra n = 3 pr. genotype og stadium. c Hæmatoxylin/Eosin-farvning af tværsnit af E8.5 og E9.0 kontrol og Setdb1 END embryoner. Sektionernes omtrentlige positioner er angivet i skemaet. Det sorte rektangel markerer det område, der bruges til forstørrelse. Røde pile angiver bagtarmsregionen. De sorte pilespidser markerer neuralrøret. Repræsentative billeder fra n = 3 pr. genotype og stadium. Kredit:Nature Communications (2022). DOI:10.1038/s41467-022-32978-7
LMU molekylærbiolog Gunnar Schotta har undersøgt, hvilke mekanismer der forhindrer endogene retrovira i at blive for aktive.
Endogene retrovira (ERV'er) har etableret sig i det menneskelige genom i løbet af evolutionen og spiller en stor rolle i normal genregulering. Overdreven ERV-aktivitet kan dog føre til sygdomme som autoimmunitet og cancer. Derfor har celler udviklet mekanismer til at genkende og dæmpe endogene retrovira.
Lyddæmpningen opnås ved at pakke de tilsvarende DNA-sektioner ind i en mindre tilgængelig struktur. Denne proces lettes af modifikationer af histonproteinerne, der pakker DNA'et (H3K9me3) og en modifikation af selve DNA'et (DNA-methylering). Det har dog ikke været klart før nu, hvilke af disse modifikationer, der er virkelig vigtige for ERV-dæmpning.
Holdet - ledet af Gunnar Schotta fra LMU's Biomedicinske Center München - har fundet ud af, at i visse celletyper er DNA-methylering afgørende, og tilstedeværelsen af H3K9me3 er ikke tilstrækkelig til at dæmpe ERV'er. Denne opdagelse giver et vigtigt grundlag, for eksempel for undersøgelsen af afvigende aktiverede ERV'er i forbindelse med sygdomme som cancer og autoimmunitet.
Undersøgelsen blev offentliggjort i Nature Communications . + Udforsk yderligere