Formålet med det menneskelige fordøjelsessystem er at nedbryde større fødevaremolekyler til mindre molekyler, som kroppens celler kan bruge. Kolhydrater, fedt og proteiner opdeles efter specifikke fordøjelsesenzymer og på bestemte steder i fordøjelsessystemet. Pepsin er placeret i maven og spiller en vigtig rolle i nedbrydningen af proteiner. Fordøjelsen af proteiner med pepsin er ikke fuldstændig, og fordøjelsesenzymer i tyndtarmen afslutter jobbet med at nedbryde madproteiner.
Maven spiller en vigtig rolle i fordøjelsen.
Maven er et sæklignende organ placeret i venstre øvre del af maven. Det er i stand til at rumme op til 2 liter mad og væske. Når mad trænger ind i maven, klynger de stærke muskler i mavevæggene maden ved at blande den med mavesaft for at producere "chyme." Mavesaft indeholder slim, saltsyre og hormonet gastrin og stimulerer sekretionen af pepsinogen, forløberenzymet til pepsin. få mavekirtler i maven til at udskille gastrisk juice. Saltsyren i mavesaften omdanner pepsinogen til pepsin ved spaltning af en række aminosyrer, der kaldes et peptid. Denne reaktion kræver en meget sur pH-værdi, der spænder mellem 1 og 3. Det sure miljø er nødvendigt til frembringelse og aktivitet af pepsin. Saltsyren i maven giver generelt en pH-værdi på ca. 1,5 til 3,5.
Pepsin nedbryder madproteiner
Syren i maven får madproteiner til at udfolde sig i en proces kaldet denaturering. Denaturering udsætter proteinets molekylære bindinger, så pepsin kan få adgang til dem og bryde proteinerne i mindre fragmenter, kaldet peptider eller polypeptider. Tyndtarmen fortsætter med at nedbryde proteiner ved at hugge peptiderne i aminosyrer, som let kan optages i blodstrømmen. Pepsin fordøjer proteiner i adskillige timer, før den delvist fordøjede madblanding langsomt overføres til tyndtarmen. saltsyre og pepsin. Mavesår er smertefulde sår, der kan opstå, når maveforingen er beskadiget. En bakterie kaldet Helicobacter pylori er i stand til at leve i et surt miljø og menes at forhindre udskillelse af beskyttende slim, hvilket tillader pepsin at lave huller i mavevæggene. Antacida virker ved at hæve pH i maven og inaktivere pepsin, da pepsin kun fungerer ved lav pH. Langtidsbrug af antacida anbefales ikke, fordi hæmning af pepsin forhindrer tilstrækkelig fordøjelse af proteiner. Absorption af ufuldstændigt fordøjede proteinfragmenter kan forårsage allergier og andre sundhedsmæssige problemer.