Central Dogma (Genekspression): Definition, trin, regulering

Det centrale dogme i molekylærbiologi forklarer, at informationsstrømmen for gener er fra DNA genetisk kode
til en mellemliggende RNA-kopi og derefter til de proteiner, der er syntetiseret fra koden. De centrale ideer, der lå til grund for dogmen, blev først foreslået af den britiske molekylærbiolog Francis Crick i 1958.

I 1970 blev det almindeligt accepteret, at RNA lavede kopier af specifikke gener fra den originale DNA-dobbelthelix og dannede grundlaget for produktion af proteiner fra den kopierede kode.

Processen med at kopiere gener via transkription af den genetiske kode og produktion af proteiner gennem translation af koden til kæder af aminosyrer kaldes genekspression
. Afhængig af cellen og nogle miljøfaktorer udtrykkes visse gener, mens andre forbliver sovende. Genekspression styres af kemiske signaler mellem celler og organer i levende organismer.

Opdagelsen af alternativ splejsning og undersøgelse af ikke-kodende dele af DNA kaldet introner
angiver, at processen beskrevet af biologiens centrale dogme er mere kompliceret, end det oprindeligt blev antaget. Den enkle DNA til RNA til proteinsekvens har grene og variationer, der hjælper organismer med at tilpasse sig et skiftende miljø. Det grundlæggende princip om, at genetisk information kun bevæger sig i en retning, fra DNA til RNA til proteiner, forbliver ubestridt.

Oplysningerne, der er kodet i proteiner, kan ikke påvirke den originale DNA-kode.
DNA-transkription finder sted i kernen

DNA-helixen, der koder for organismenes genetiske information, findes i kernen i eukaryote celler. Prokaryotiske celler er celler, der ikke har en kerne, så DNA-transkription, translation og proteinsyntese foregår alle i cellens cytoplasma via en lignende (men enklere) transkription /translationsproces
.

I eukaryote celler kan DNA-molekyler ikke forlade kernen, så celler er nødt til at kopiere den genetiske kode for at syntetisere proteiner i cellen uden for kernen. Transkriptionskopieringsprocessen initieres af et enzym kaldet RNA-polymerase
og det har følgende trin:

1. Start. RNA-polymerasen adskiller midlertidigt de to strenge af DNA-helixen. De to DNA-helixstrenge forbliver fastgjort på hver side af gensekvensen, der kopieres.
   

2. Kopiering. RNA-polymerasen bevæger sig langs DNA-strengene og fremstiller en kopi af et gen på en af strengene.
   
   

3. Splejsning. DNA-strengene indeholder proteinkodende sekvenser kaldet exons
   , og sekvenser, der ikke bruges til proteinproduktion kaldes introner
   . Da formålet med transkriptionsprocessen er at fremstille RNA til syntesen af proteiner, kasseres introndelen af den genetiske kode ved hjælp af en splejsningsmekanisme.
   
   
   
   

   DNA-sekvensen kopieret i det andet trin indeholder exoner og introner og er en forløber for messenger-RNA.
   

   For at fjerne intronerne skæres pre-mRNA
   streng ved en intron /exon-grænseflade. Strengens introndel danner en cirkulær struktur og forlader strengen, så de to eksoner fra hver side af intronet kan samles. Når fjernelsen af intronerne er afsluttet, er den nye mRNA-streng moden mRNA
   , og den er klar til at forlade kernen.
   mRNA har en kopi af koden til et protein
   

   Proteiner er lange strenge af aminosyrer forbundet med peptidbindinger. De er ansvarlige for at påvirke, hvordan en celle ser ud, og hvordan den gør. De danner cellestrukturer og spiller en vigtig rolle i metabolismen. De fungerer som enzymer og hormoner og er indlejret i cellemembraner for at lette overgangen af store molekyler.
   

   Sekvensen af strengen af aminosyrer til et protein er kodet i DNA-spiralen. Koden består af følgende fire nitrogenholdige baser
   :
   
   

4. Guanine (G)
   
5. Cytosin (C)
   
6. Adenin (A )
   
7. Thymin (T)
   
   

   Disse er nitrogenholdige baser, og hvert led i DNA-kæden består af et basepar. Guanin danner et par med cytosin, og adenin danner et par med thymin. Linksne får navn med et bogstav, afhængigt af hvilken base der kommer først i hvert link. Baseparrene kaldes G, C, A og T for guanin-cytosin-, cytosin-guanin-, adenin-thymin- og thymin-adenin-forbindelser.
   

   Tre basepar viser en kode for en bestemt aminosyre og er kaldte et kodon
   . Et typisk kodon kaldes muligvis GGA eller ATC. Fordi hvert af de tre kodonsteder for et basepar kan have fire forskellige konfigurationer, er det samlede antal kodoner 4 ^{3 eller 64.}
   

   Der er omkring 20 aminosyrer, der bruges til proteinsyntese, og der er også kodoner til start- og stopsignaler. Som et resultat er der nok kodoner til at definere en sekvens af aminosyrer for hvert protein med nogle redundancier.
   

   MRNA er en kopi af koden for et protein.
   Proteiner produceres af ribosomer
   

   Når mRNA forlader kernen, ser det efter en ribosom til at syntetisere proteinet, som det har de kodede instruktioner.
   

   Ribosomer er fabrikkerne i cellen, der producerer cellens proteiner. De består af en lille del, der læser mRNA og en større del, der samler aminosyrerne i den rigtige sekvens. Ribbosomet består af ribosomalt RNA og tilhørende proteiner.
   

   Ribosomer findes enten flydende i cellens cytosol
   eller knyttet til cellens endoplasmatiske retikulum (ER), en række membranindkapslede sække fundet nær kernen. Når de flydende ribosomer producerer proteiner, frigives proteinerne i cellen cytosol.
   

   Hvis ribosomerne, der er knyttet til ER, producerer et protein, sendes proteinet uden for cellemembranen, der skal bruges andre steder. Celler, der udskiller hormoner og enzymer, har normalt mange ribosomer knyttet til ER og producerer proteiner til ekstern brug.
   

   MRNA bindes til et ribosom, og oversættelsen af koden til det tilsvarende protein kan begynde.
   Oversættelse samler et specifikt protein i henhold til mRNA-koden
   

   Flydende i cellen cytosol er aminosyrer og små RNA-molekyler kaldet transfer RNA
   eller tRNA. Der er et tRNA-molekyle for hver type aminosyre, der bruges til proteinsyntese.
   

   Når ribosomet læser mRNA-koden, vælger det et tRNA-molekyle til at overføre den tilsvarende aminosyre til ribosomet. TRNA bringer et molekyle af den specificerede aminosyre til ribosomet, som binder molekylet i den rigtige sekvens til aminosyrekæden.
   

   Begivenhedsforløbet er som følger:
   

   1. Indledning. Den ene ende af mRNA-molekylet binder til ribosomet.
      
   2. Oversættelse. Ribosomet læser det første kodon af mRNA-koden og vælger den tilsvarende aminosyre fra tRNA. Ribosomet læser derefter det andet kodon og fastgør den anden aminosyre til det første.
      
   3. Afslutning. Ribosomet arbejder sig ned ad mRNA-kæden og producerer en tilsvarende proteinkæde på samme tid. Proteinkæden er en sekvens af aminosyrer med peptidbindinger og danner en polypeptidkæde
      .
      
      

      Nogle proteiner produceres i batches, mens andre syntetiseres kontinuerligt til imødekomme de igangværende behov i cellen. Når ribosomet producerer proteinet, er informationsstrømmen for den centrale dogme fra DNA til protein fuldstændig.
      Alternativ splejsning og virkningerne af introner
      

      Alternativer til den direkte informationsstrøm, der er planlagt i den centrale dogme, er for nylig blevet undersøgt. Ved alternativ splejsning skæres præ-mRNA'en for at fjerne introner, men sekvensen af eksoner i den kopierede DNA-streng ændres.
      

      Dette betyder, at en DNA-kodesekvens kan give anledning til to forskellige proteiner. Mens introner kasseres som ikke-kodende genetiske sekvenser, kan de påvirke exon-kodning og kan være en kilde til yderligere gener under visse omstændigheder.
      

      Mens det centrale dogme i molekylærbiologi forbliver gyldigt med hensyn til informationsstrømmen , detaljerne om nøjagtigt, hvordan informationen flyder fra DNA til proteiner, er mindre lineære end oprindeligt antaget.