Hvorfor endonukleaseenzym skåret DNA mellem 5 og 3?

Det er et godt spørgsmål! Endonukleaser skærer faktisk ikke DNA "mellem" 5 'og 3' ender. De skærer inden for selve DNA -strengen, og deres aktivitet bestemmes af sekvensen af ​​baser, de genkender. Her er hvorfor:

* DNA -struktur: DNA er en dobbelt helix sammensat af to antiparallelle strenge. Den ene streng løber 5 'til 3', og den anden kører 3 'til 5'.

* Endonucleases 'mål: Endonukleaser er enzymer, der bryder phosphodiesterbindingerne inden for en DNA -streng. De har specifikke genkendelsessteder, som er korte sekvenser af baser.

* specificitet af skæring: En endonuklease vil kun skære på sit genkendelsessted, uanset den samlede 5 'til 3' retningsbestemmelse af DNA -strengen.

Her er et forenklet eksempel:

Forestil dig, at en endonuklease genkender sekvensen "Gaattc." Det vil skære inden for denne sekvens, uanset om den streng, den virker på, er 5 'til 3' streng eller 3 'til 5' streng.

Kortfattet: Endonukleaser skærer ikke "mellem" de 5 'og 3' ender af DNA -molekylet. De skar * inden for * strengen ved specifikke sekvenser, de genkender. Deres handling dikteres af basissekvensen og ikke retningen af ​​DNA -strengen.