Hvad er en DNA -størrelsesstandard, og hvorfor den bruges i gelelektroforese?

DNA -størrelse standard i gelelektroforese

En DNA -størrelsesstandard, også kendt som en DNA -stige eller molekylvægtmarkør, er en blanding af DNA -fragmenter med kendte størrelser. Det bruges i gelelektroforese som en henvisning til at bestemme størrelsen på ukendte DNA -fragmenter i en prøve.

Her er hvorfor det er afgørende:

1. Størrelsesbestemmelse:

* Under elektroforese migrerer DNA -fragmenter gennem gelmatrixen baseret på deres størrelse. Mindre fragmenter bevæger sig hurtigere og længere, mens større fragmenter bevæger sig langsommere og forbliver tættere på brønden.

* Ved at køre størrelsesstandarden sammen med prøven kan du visuelt sammenligne migrationsafstanden for ukendte fragmenter med de kendte størrelser i standarden.

* Dette giver dig mulighed for at estimere størrelsen på dine DNA -fragmenter i basepar (BP) eller kilobasepar (KB).

2. Visualisering og analyse:

* Størrelsesstandarden hjælper med at visualisere adskillelsen af ​​DNA -fragmenter i gelen. Det skaber forskellige bånd svarende til de kendte størrelser og danner et stige-lignende mønster.

* Dette mønster fungerer som en visuel guide til analyse af prøvebåndene. Du kan nemt identificere størrelsesområdet for dine prøvefragmenter ved at sammenligne deres position i forhold til standarden.

3. Kvalitetskontrol:

* Størrelsesstandarden fungerer som en kvalitetskontrolforanstaltning. Det sikrer, at gelelektroforese -kørslen er vellykket, og adskillelsen af ​​DNA -fragmenter er optimal.

* Hvis størrelsesstandardbåndene ikke er klart defineret eller migrerer forkert, indikerer det potentielle problemer med elektroforeseopsætningen eller betingelserne.

4. Fejlfinding:

* Analyse af størrelsesstandarden kan hjælpe med at fejlfinde problemer med gelelektroforese -eksperimentet.

* For eksempel, hvis et prøvebånd forekommer større end forventet, kan det antyde ufuldstændig fordøjelse eller nedbrydning af DNA'et.

Typer af DNA -størrelsesstandarder:

Der er forskellige typer DNA -størrelsesstandarder tilgængelige kommercielt, der spænder i størrelse og antallet af fragmenter. De indeholder typisk en blanding af lineære DNA -fragmenter med forskellige størrelser.

Kortfattet:

En DNA -størrelsesstandard er et vigtigt værktøj til gelelektroforese. Det giver en reference til størrelse bestemmelse, visualisering, kvalitetskontrol og fejlfinding, hvilket muliggør nøjagtig analyse af DNA -fragmenter i en prøve.