Automatiseret klargøring af MS-følsomme fluorescensmærkede N-Glycaner med en pipeteringsrobot

En ny original forskningsrapport tilgængelig forud for tryk på SLAS teknologi demonstrerer semi-automatiseringen af ​​et GlycoWorks RapiFluor-MS (RFMS) Kit ved hjælp af en pipetteringsrobot til at forbedre biovidenskabens forskningsproduktivitet. Denne robotplatform bruger standard manuelle pipetter og en optisk styret arm for at lette automatiseringen af ​​manuelle procedurer, reducere den tid, forskere bruger ved laboratoriebænken, og efterligne, så tæt som muligt, resultaterne opnået ved brug af den manuelle GlycoWorks RFMS-protokol.

GlycoWorks RapiFluor-MS (RFMS) Kit blev lanceret i 2015 og forenkler den måde, forskere er i stand til at frigive og mærke N-bundne glykaner på. Sættet gør det muligt for analytikere at udføre en højtydende prøveforberedelse og sikrer præcise og repeterbare N-glycan-profiler. RFMS-tagget er unikt ved, at det giver hurtig tagging og suveræn følsomhed til både optiske og massespektrometriske analyser.

Forfattere Corey Reed, Jennifer Fournier og Stephan Koza fra Waters Corporation (Milford MA) og Nikolas Vamvoukas fra Andrew Alliance forenkler denne prøveforberedelsesprotokol yderligere gennem automatisering ved hjælp af en kommercielt tilgængelig robotløsning fra Andrew Alliance. Andrew, pipetteringsrobotten, præsenterer en ideel platform til automatisering af dette sæt med dets evne til at pipettere små volumener og tilpasse sig volumenvariabilitet med tilpassede dominobrikker bygget specifikt til denne løsning.

For nøjagtigt at gengive resultaterne af den manuelle protokol, temperaturfølsomme trin er re-optimeret til den automatiserede platform, og en række temperaturer testes for at opnå maksimal N-glycan frigivelseseffektivitet. Efter mindre justeringer, den automatiserede protokol viser sig at være statistisk sammenlignelig med den manuelle protokol med hensyn til genvinding af RFMS-mærkede N-glycaner såvel som de resulterende fluorescens relative topområder. Ud over, en underrutine i proceduren forenkler prøvekoncentrationsnormaliseringsprocessen forud for RFMS-protokollen, sparer brugerne betydelige mængder tid.

Til sidst, forfatterne tager en robust og brugervenlig protokol og udvider med succes fordelene ved biovidenskabelig forskning ved at øge laboratorieproduktiviteten. Brugere kan nu problemfrit skifte fra den manuelle protokol til den automatiserede løsning, fritage brugere fra monoton pipettering og kontrol af nøgleområder i protokollen, der normalt er tilbøjelige til brugerfejl.