Den vigtigste energikilde i en skyggefuld strøm er alloktont organisk stof, som refererer til organisk materiale, der stammer fra uden for vandløbets økosystem. Dette organiske stof kommer fra forskellige kilder, herunder nedfaldne blade, kviste, grene og andet plantemateriale fra flodtræer, såvel som landlevende insekter og dyr, der falder i åen. Alloktont organisk materiale giver vital energi og næringsstoffer, der understøtter fødenettet og den overordnede økosystemdynamik i den skyggefulde strøm. Detritivorer såsom makroinvertebrater nedbryder dette organiske stof og frigiver næringsstoffer, der gavner primærproducenter (f.eks. alger og mosser) gennem nedbrydningsprocessen. Disse primære producenter tjener derefter som føde for efterfølgende trofiske niveauer, herunder insekter, fisk og andre vandlevende organismer, og danner et levende økosystem centreret omkring denne eksterne energikilde.