Den energi, der går tabt i en mikrobølgeovn, er primært i form af varme. Mikrobølger er en form for elektromagnetisk stråling, og når de interagerer med mad, får de vandmolekylerne i maden til at vibrere. Denne vibration genererer varme, som tilbereder maden. Nogle af mikrobølgerne optages dog også af ovnens vægge og omdannes til varme, som går tabt til miljøet. Derudover kan nogle af mikrobølgerne slippe ud gennem ovndøren, hvilket også resulterer i energitab.