For at køle en atomkraftreaktor i rummet skal der bruges et aktivt kølesystem. Dette system ville bruge en væske, såsom vand eller flydende natrium, til at transportere varme væk fra reaktorkernen. Væsken ville derefter blive pumpet gennem en radiator, hvor den ville blive afkølet af rummets kolde vakuum. Den afkølede væske ville derefter blive returneret til reaktorkernen, og cyklussen ville gentage sig.
Aktive kølesystemer er komplekse og kræver en betydelig mængde strøm for at fungere. De er dog den eneste effektive måde at køle en atomkraftreaktor på i rummet.