Bor er et grundstof med atomnummer 5, hvilket betyder, at det har 5 protoner i sin kerne. Antallet af elektroner i et atom er normalt lig med antallet af protoner, så bor har 5 elektroner. Hvad angår neutroner, kan antallet variere afhængigt af isotopen af bor. Den mest almindelige isotop, bor-11, har 6 neutroner, mens den mindre almindelige isotop bor-10 har 5 neutroner.