De tidligste kendte eukaryote fossiler går tilbage til omkring 2,1 milliarder år siden og giver bevis på et bemærkelsesværdigt niveau af mangfoldighed og kompleksitet, hvilket udfordrer tidligere antagelser om enkeltheden af tidligt eukaryot liv. Her er nogle eksempler:
Grypania spiralis:
Opdaget i 1990, Grypania spiralis er et 1,9 milliarder år gammelt mikrofossil, der udviser kendetegnene for eukaryot kompleksitet. Den har en spiralstruktur, indviklede cellulære rum, en mulig kerne og potentialet for bevægelse ved hjælp af flageller.
Bangiomorpha pubescens:
Fundet i klipper, der er cirka 1,2 milliarder år gamle, viser Bangiomorpha pubescens træk ved flercellethed. Den består af forgrenede filamenter, der består af individuelle celler, med specialiserede reproduktive strukturer, der indikerer en evne til seksuel reproduktion.
Horodiskia moniliformis:
Horoodyskia moniliformis går tilbage til omkring 1,6 milliarder år siden og afslører en meget organiseret og kompleks anatomi. Denne encellede organisme udviser særskilte interne strukturer i sine celler, herunder opdelte rum indeholdende fotosyntetiske pigmenter.
Ediacaran-fossiler:
Ediacaran-perioden (635 millioner til 541 millioner år siden) markerer en bemærkelsesværdig diversificering af komplekse flercellede organismer. Selvom de mangler direkte beviser for eukaryote affiniteter, tyder de indviklede former og den store størrelse af Ediacaran-biota, såsom Dickinsonia og Spriggina, på avanceret organisatorisk kompleksitet og specialisering.
Tilstedeværelsen af så forskelligartede og komplekse eukaryoter i den tidlige fossilregistrering fremhæver den undervurderede rigdom af liv, der eksisterede længe før fremkomsten af avancerede dyr og planter. Det understreger forestillingen om, at eukaryotisk liv gennemgik betydelig evolutionær innovation og diversificering meget tidligt i Jordens historie.