Sådan beregnes det isoelektriske punkt af peptider

Peptider er korte polymerfragmenter sammensat af aminosyrer. Hvert peptid har en bestemt aminosyresekvens betegnet med en trebogstav eller en bogstavkode; for eksempel forkortes aminosyrealaninen som "Ala" eller "A." Ladningen af ​​peptiderne i opløsningen afhænger af opløsningens surhedsgrad. Det isoelektriske punkt (pI) henviser til opløsningens surhedsværdi, ved hvilken peptidmolekylet har nettoladningen på nul. Løseligheden af ​​peptidet er minimal ved det isoelektriske punkt. Brug tilgængelige webservers til at beregne pI-værdien for en peptidsammensyresekvens.

Skriv peptidsekvensen ved hjælp af enbogstavskoden. For eksempel, hvis et peptid har en aminosyresekvens Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin-Serin-Glumatisk Syre-Leucin-Prolin), er den ene bogstavsekvens "ASELP." Hvis det er nødvendigt, konsultere det tre bogstav til en bogstavkonverteringstabel, der er angivet i Resources.

Brug en webbrowser, Internet Explorer eller Firefox til at navigere til en server, der beregner peptidets isoelektriske punkt (pI); Se Ressourcer.

Indtast peptid-en-bogstavsekvensen - "ASELP" i vores eksempel i boksen, og klik på "Beregn."

Læs den isoelektriske punkt (pI) -værdi givet i linjen "Teoretisk pI /Mw." I vores eksempel er pI 4,00. Bemærk, at serveren også beregner molekylvægten (Mw) af peptidet.