Kortlægning af biologiske funktioner for NUDIX -enzymer

I et stort tværfagligt projekt, forskere ved Karolinska Institutet har undersøgt forskellige egenskaber ved en enzymfamilie kaldet NUDIX -hydrolaser. Studiet, udgivet i Naturkommunikation , afslører ny indsigt i deres biologiske funktioner i menneskelige celler.

NUDIX -enzymerne er involveret i flere vigtige cellulære processer, såsom cellulær metabolisme, homeostase og mRNA -behandling. Selvom den er meget bevaret i alle organismer, deres individuelle strukturelle, biokemiske og biologiske egenskaber er fortsat stort set uklare.

For at løse dette, Professor Thomas Helleday og adjunkt Jordi Carreras-Puigvert ved Karolinska Institutets Institut for Medicinsk Biokemi og Biofysik og Videnskab for Livslaboratorium (SciLifeLab) indledte et samarbejde med forskere ved Uppsala University, Stockholms universitet, universitetet i Ljubljana i Slovenien, og medlemmer af Human Protein Atlas.

Omfattende enzymprofilkort

Samarbejdet har resulteret i omfattende data om individuelle egenskaber og indbyrdes forhold mellem 18 humane NUDIX -enzymer, afslører fire store strukturelle klasser. Ved hjælp af en ny algoritme, forskerne integrerede alle data og skabte et omfattende NUDIX -enzymprofilkort.

"Dette kort afslører ny indsigt i substratselektivitet og biologiske funktioner i NUDIX -hydrolaser og udgør en platform for at udvide deres anvendelse som biomarkører og potentielle nye kræftlægemål", siger Jordi Carreras-Puigvert.

Det tværfaglige projekt omfattede analyser inden for biokemi, strukturel biologi, funktionel genomik, genekspression, proteinudtryk og bioinformatik.