Dette billede i høj opløsning viser strukturen af Zika -virus. De tre konvolutglykoproteiner (E) er farvet i gult, blå og rød, og glycan er farvet i grønt. Kredit:Sevvana et al.
Forskere har skabt det mest nøjagtige billede af Zika til dato, finde sandsynlige lægemiddelbindende lommer på virusets overflade og baner vejen for vaccinedesign.
Purdue-forskere var de første til at opdage strukturen af Zika-virus i 2016. Ved hjælp af kryo-elektronmikroskopi (cryo-EM), de skabte et billede af virussen i en opløsning på 3,8 Ångström, en enhed, der bruges til at udtrykke størrelsen af atomer og molekyler. Nu, de har nedskaleret dette tal til 3,1, bringe dem endnu tættere på at se atomiske detaljer om virussen. Resultaterne blev offentliggjort i tidsskriftet Struktur (Celletryk).
"Dette er det mest nøjagtige billede, vi har af virussen hidtil, "sagde Michael Rossmann, Hanley Distinguished Professor of Biological Sciences på Purdue. "Disse resultater vil give os måder til effektivt at designe antivirale forbindelser og danne grundlag for strukturbaseret vaccinedesign."
Forskergruppen brugte nye metoder til forberedelse af virus og opdaterede databehandlingsteknikker for at få denne forbedrede opløsning. Resultatet af cryo-EM er et elektronpotentialekort, som kan tolkes ved at bygge en atommodel. Den bedste pasform mellem modellen og kortet opnås ved hjælp af statistiske justeringer kendt som "forfining".
"Vores team udvidede og optimerede de rutinemæssige krystallografiske raffineringsmetoder, "Sagde Rossmann.
Zika -virus tilhører familien af flavivirus, der overføres af myg og flåter. Rossmanns team sammenlignede den nye Zika -struktur med andre flavivirus såsom Dengue, West Nile og japansk encephalitis virus, som er strukturelt ens, men forårsager forskellige sygdomssymptomer. Zika -virus får babyer til at blive født med unormalt små hoveder og undertiden mindre hjerner, en tilstand kendt som mikrocefali, og kan resultere i Guillain-Barre syndrom hos voksne. Dengue feber, på den anden side, forårsager influenzalignende symptomer og hududslæt.
"Vi sammenlignede overfladeegenskaberne af disse vira og observerede forskelle i landskabet for de overfladeeksponerede rester, "sagde Madhu Sevvana, en postdoktor ved Purdue og hovedforfatter af papiret. "Vi fandt visse strukturelle forskelle på overfladen, hvilket kunne være et udgangspunkt for yderligere mutationsanalyser. "