Mobil, øjeblikkelig diagnose af vira

I en første for plantevirologi, et hold fra CIRAD brugte for nylig nanopore-teknologi til at sekventere hele genomerne af to yam-RNA-vira. Denne lidt brugte, men lovende molekylærbiologiske teknik baner vejen for nye værktøjer til feltdiagnose af planter, dyr og mennesker.

En ny, Høj gennemstrømning, bærbar sekventeringsteknik er blevet udviklet i de senere år til sundhedsformål for mennesker og dyr. Det bruger mobile laboratorier til næsten øjeblikkeligt at diagnosticere vira som Ebola eller Zika, i marken. Diagnosen er hurtig og tidlig, hvilket undgår behovet for at overføre kontaminerede prøver.

"Teknologien er karakteriseret ved produktion af lange nukleotidsekvenser, som gør det muligt at sekventere hele det virale genom, "Philippe Roumagnac, en virolog med CIRAD, forklarer. CIRAD var et af de første laboratorier i verden, der testede og validerede dets anvendelse i plantevirologi. "Ved at bruge en syg yam plante, det tog os kun et par timer at sekventere hele genomet af to enkeltstrengede RNA-vira, et macluravirus og et potyvirus, " tilføjer hans kollega Denis Filloux.

Som med menneskelig virologi, det faktum, at teknikken nu er blevet valideret i et plantevirologisk laboratorium, baner vejen for realtid, mobil detektion af kroniske, sæsonbestemte eller nye plantevirus, selv i isolerede områder. Ved at forkorte den tid, der går mellem prøvetagning og diagnose, teknologien vil hjælpe epidemioovervågningsnetværk med at opdage skadelige organismer på et tidligere tidspunkt.