Udtrække information fra gamle tænder

Der er en overraskende mængde information gemt i den hærdede plak, eller beregning, mellem tænderne. Og hvis den beregning tilhører resterne af en person, der levede i oldtiden, oplysningerne kunne afsløre ny indsigt om fortiden. Men de små prøver kan være svære at arbejde med. Nu, i ACS' Journal of Proteome Research , videnskabsmænd anvender en ny metode til denne analyse, finde flere proteiner end traditionelle metoder.

Den menneskelige mund er fuld af interessante molekyler:DNA og enzymer i spyt, proteiner og lipider fra madstykker, der sidder fast mellem tænderne, de bakterielle borgere i det orale mikrobiom. Under de rette forhold, disse molekyler kan bevares i dental calculus i tusinder af år. At identificere de biomolekyler, der er bevaret i gammel plak, giver forskerne fingerpeg om, hvordan vores forfædre levede, hvad de spiste, hvilke sygdomme de havde og mere. Imidlertid, der er kun så meget plak, man kan skrabe af gamle tænder, så det er vigtigt at anvende metoder, der kan udtrække mest information fra små prøver. Selvom der ikke findes en guldstandardmetode til beregningsanalyse, filterbaserede teknikker bruges ofte, men de kan være tidskrævende og kan indføre forurenende stoffer. Så, hold ledet af Michael Buckley og Cheryl Makarewicz ønskede at se, om en anden metode, kaldet single-pot, fastfase-forstærket prøveforberedelse (SP3), kunne forbedre antallet og kompleksiteten af ​​proteinfragmenter, der kunne analyseres fra bevaret plak.

Forskerne, ledet af Karren Palmer, anvendt SP3 til analysen af ​​calculus fra 153 oldtidsindivider, der stammer fra mellem 1 ^st og 4 ^th århundrede fvt. Med SP3, funktionaliserede magnetiske perler grebet ind i proteinfragmenter, gør dem nemme at analysere ved massespektrometri. Forskerne fandt ud af, at SP3 pålideligt øgede antallet af unikke proteinfragmenter, de kunne identificere i prøver, herunder mindre peptider end to andre metoder, ultrafiltrering og acetoneudfældning, savnet. SP3 var også let at udføre og mindre tilbøjelig til at introducere forurenende stoffer end de andre metoder. Ved at bruge denne tilgang, forskerne identificerede fragmenter af mejeriproteiner fra forsøgspersonernes kostvaner, samt bakterielle proteiner, der kunne kaste lys over gamle sygdomme.