Udsigter fra krystalstrukturer af FIH i kompleks med ASPP-afledte peptider. En (venstre) sekvensjustering af ASPP-proteiner med rapporterede FIH-substrater. (Højre) Overlejring af krystalstrukturafledte billeder af FIH i kompleks med ASPP2 og HIF-1α (PDB-kode 1H2K, 2,15 Å), der viser den bevarede natur af substratbinding. B Udsigter fra den dimere struktur af FIH i kompleks med et iASPP-afledt peptid (rest 670-693), et ASPP1-afledt peptid (rest 932-954) og et ASPP2-afledt peptid (rest 969-991). C Nærbilleder fra krystalstrukturer af FIH i kompleks med ASPP-afledte peptider, Fo-Fc OMIT-kortene, vist i grønt net, er kontureret til 3σ. Kredit:Journal of Biological Chemistry (2022). DOI:10.1016/j.jbc.2022.102020
Faktorinhiberende hypoxia-inducerbar faktor (FIH) spiller en vigtig rolle i responsen på lavt iltindhold (hypoxi) hos dyr. FIH tilføjer en hydroxylgruppe (-OH) til masterregulatoren Hypoxia Inducible Factor (HIF), hvilket påvirker dens evne til at aktivere hundredvis af gener, der medierer kroppens reaktion på hypoxi. Det hydroxylerer også medlemmer af ankyrin-gentagelsesdomæneproteinfamilien, herunder tilføjelse af en enkelt hydroxylgruppe til ASPP2 på asparagin 986.
ASPP2 er involveret i flere aspekter af cancerbiologi, herunder reguleringen af cellepolaritet/adhæsion og transkriptionsaktiviteten af tumorsuppressorproteinet p53. Effekten af hydroxylering af FIH på ASPP2's aktivitet er dog stadig uklar.
En undersøgelse ledet af den tidligere Ludwig Oxford-forsker Thomas Leissing og hans Oxford-kollega Christopher Schofield, udført i samarbejde med laboratorier af Ludwig Oxford-direktør Xin Lu og Ludwig-medlem Peter Ratcliffe, undersøgte hydroxyleringen af ASPP2 og andre ankyrin-gentagelsesdomæneproteiner.
Uventet, ud over det kendte sted for hydroxylering, afslørede holdet FIHs evne til at tilføje hydroxylgrupper til begge asparaginrester inden for "VNVN"-motivet, der er til stede i ASPP-proteiner. Yderligere karakterisering bekræftede, at dette var en ny type post-translationel hydroxylering.
Fremtidigt arbejde vil definere rollen af denne hidtil usete modifikation af FIH i ankyrin-gentagelsesdomænets proteinbiologi og i responsen på hypoxi.
Denne forskning er offentliggjort i Journal of Biological Chemistry . + Udforsk yderligere
Sidste artikelLavpris gelfilm kan plukke drikkevand fra ørkenluften
Næste artikelNyligt udviklet enzym fremskynder langsom organisk reaktion