De positivt ladede partikler i et atoms kerne kaldes protoner. Protoner er en af de tre subatomære partikler, der udgør atomer, sammen med neutroner og elektroner. Antallet af protoner i et atom bestemmer dets elementidentitet og er repræsenteret ved atomnummeret. Hvert grundstof i det periodiske system har et unikt atomnummer, som svarer til antallet af protoner i dets kerne.
Protoner har en positiv elektrisk ladning på +1, hvilket bidrager til kernens samlede positive ladning. Tiltrækningen mellem de positivt ladede protoner og de negativt ladede elektroner i et atom er det, der holder atomet sammen og forhindrer det i at gå i opløsning. Antallet af protoner i et atom bestemmer også dets kemiske egenskaber og adfærd.