Forbrænding af naturgas udleder primært kuldioxid (CO2), nitrogenoxider (NOx) og nogle spormængder af svovldioxid (SO2). Mens NOx kan bidrage til dannelsen af sur regn, er SO2-emissionerne fra naturgas væsentligt lavere sammenlignet med kul- eller olieforbrænding. Derfor betragtes naturgas generelt som et renere brændstof med hensyn til dannelse af sur regn.