Nej, det er ikke muligt at se et enkelt molekyle med det blotte øje. Molekyler er ekstremt små, og deres størrelser måles typisk i nanometer (nm). En nanometer er en milliardtedel af en meter, og de fleste molekyler er kun få nanometer store. De mindste objekter, der kan ses med det blotte øje, er generelt omkring 100 mikrometer (µm) i størrelse, hvilket er omkring 100.000 gange større end et molekyle. Det betyder, at det uden hjælp af et mikroskop er umuligt at se et enkelt molekyle.