1. aminogruppe (NH2) :Denne gruppe indeholder nitrogen- og brintatomer.
2. carboxylgruppe (COOH) :Denne gruppe indeholder carbon-, ilt- og brintatomer.
3. Sidekæde (R Group) :Denne gruppe varierer afhængigt af den specifikke aminosyre og bestemmer dens unikke egenskaber.
Det er vigtigt at huske, at alpha carbon er det centrale carbonatom, som alle tre grupper er knyttet til.