Sådan beregnes et proteins isoelektriske punkt (pI) nøjagtigt

Af bidragyder
Opdateret 24. marts 2022

Det isoelektriske punkt (pI) er den pH-værdi, ved hvilken et protein ikke bærer nogen nettoladning. Det er en grundlæggende egenskab i biokemi, der påvirker opløselighed, stabilitet og interaktion med andre molekyler. Fordi pI afhænger af et proteins aminosyresammensætning, skal du bruge den nøjagtige sekvens for at beregne den.

Trin 1:Få proteinsekvensen

Hvis du allerede har sekvensen, skal du springe til trin 8. Ellers skal du hente den fra UniProt database.

Trin 2:Søg i UniProt

Indtast proteinnavnet eller søgeordet i søgefeltet, og klik på Søg .

Trin 3:Find posten

Gennemse resultaterne, vælg den korrekte post, og noter dens adgangsnummer.

Trin 4:Få adgang til ExPASy's pI-beregner

Naviger til ExPASy Compute pI/Mw værktøj.

Trin 5:Indtast adgangsnummeret

Indsæt adgangsnummeret i det angivne felt, og klik Klik her for at beregne pI/Mw .

Trin 6:Indsend

Klik på Send knappen på næste skærmbillede.

Trin 7:Hent resultatet

Aflæs den viste isoelektriske punkt (pI).

Trin 8:Manuel sekvensindtastning (hvis nødvendigt)

Vend tilbage til ExPASy-værktøjet og indsæt eller skriv sekvensen direkte i inputfeltet.

Trin 9:Beregn

Klik Klik her for at beregne pI/Mw igen.

Trin 10:Se pI

Observer det beregnede isoelektriske punkt, som du nu kan bruge i dit eksperimentelle design.

For mere avancerede analyser kan du overveje at bruge ExPASy Protein Tools suite, som tilbyder yderligere funktioner såsom molekylvægtsberegning og pH-afhængige egenskaber.