Videnskab
 science >> Videnskab >  >> nanoteknologi

Opløsning af den interne struktur af nanopartikeldimerer forbundet med DNA

Figur A:Beregnet fordeling af interpartikelseparation, r, for dimerer forbundet med enten en eller fire DNA -kæder. Den gennemsnitlige adskillelse faldt med et stigende antal partikelforbindelseskæder.

Lys- og røntgenspredningseksperimenter har afsløret strukturen af ​​nanopartikeldimerer forbundet af fleksible DNA-kæder. Disse dimerer var grundlæggende enheder i en multi-skala, hierarkisk forsamling, og fungerede som et modelsystem til at forstå DNA-medierede interaktioner, især i det ikke-trivielle regime, hvor nanopartikel- og DNA-forbindelserne var sammenlignelige i størrelse. Vi fandt ud af, at adskillelsen mellem partikler i dimeren primært var styret af antallet af bindende DNA. Forskere opsummerer deres resultater i en simpel model, der fangede samspillet mellem antallet af DNA-broer, deres længde, nanopartiklernes krumning, og de udelukkede volumeneffekter. Vi demonstrerede fremragende overensstemmelse med vores analytiske model med både vores eksperimentelle og beregningsmæssige resultater, uden brug af frie parametre i modellen.

Som byggesten i multi-skala samlinger, DNA-koblede nanopartikeldimerer er fremragende modelsystemer til at forstå kædemedierede interaktioner mellem partikler. Resultaterne af denne undersøgelse kan tjene til at vejlede designet af præcist kontrollerede afstande inden for nanoskala klynger; sådan kontrol er bydende nødvendigt for energioverførsel og biodetektionsfunktioner, blandt andre applikationer.

Figur B:Simuleringsprotokol for dimerdannelse af to DNA-coatede NP'er forbundet med fire linkere. (a) To DNA-coatede NP'er og fire linkere (lyserøde strenge) er placeret i tilfældige positioner. (b) Fire tråde af en halvkugle af hver NP vælges tilfældigt. (c) Hybridisering finder sted mellem linkerne og strengene af venstre NP. (d) Hybridisering med anden NP efterfulgt af ækvilibrering.

Detaljer:

  • CFN-egenskaber:røntgenstråler ved CFN/NSLS X9-endestation, UV-Vis, Dynamisk lysspredning, og TEM muliggjorde undersøgelser af selvsamlingsprocesserne af de DNA-koblede dimerer. CFN/NSLS X9 endestation og dynamisk lysspredning lettede også in-situ sondering af interpartikelafstanden inden for dimererne.
  • Når nanopartikler og DNA -kæder er af sammenlignelig størrelse, adskillelsen mellem partikler i en dimer afviger fra en fri-kæde-adfærd:i så fald, den veletablerede afhængighed af kædelængden undertrykkes på grund af tilstedeværelsen af ​​flere DNA-forbindelser mellem de stærkt buede overflader af nanopartiklerne. Vores analytiske model viser fremragende overensstemmelse med både eksperimentelle og beregningsmæssige resultater.



Varme artikler