Nanopolymer-modificeret protein array kan identificere kræftbiomarkør, der er svær at finde

En biokemiker fra Purdue University har udviklet en ny metode til at påvise visse typer proteiner, der tjener som indikatorer for kræft og andre sygdomme.

Glykoproteiner dannes, når sukkerarter binder sig til og modificerer et protein. I nogle tilfælde, en kombination af glykoproteiner til stede i en prøve af blod eller urin kunne være en indikator for sygdom eller cancer.

Men disse glykoproteiner kan være uhåndgribelige. Der har ikke været noget antistof til at skelne mellem dem og almindelige proteiner. Og de komplekse og voluminøse sukkergrupper kan gøre det svært for selv standardproteindetekteringsantistoffer at finde deres mål.

W. Andy Tao, en Purdue professor i biokemi, har udviklet et nyt proteinarray, en platform med høj kapacitet til at analysere flere proteiner parallelt, til adskillelse af glykoproteiner fra umodificerede proteiner. Tao demonstrerede også sin effektivitet til at identificere glykoproteiner forbundet med blærekræft. Resultaterne blev offentliggjort mandag (14. november) i Journal of the American Chemical Society .

Tao udviklede en polymer i nanostørrelse, kaldet polyGPA, der binder sig til sukkergrupperne af glykoproteiner og bringer dem til overfladen af ​​proteinarrayet. Nanopolymeren placerer også glykoproteinet, så de antistoffer, der bruges til at detektere umodificerede proteiner, bedre kan nå deres mål.

"Der er mange sukkertyper og kombinationer. Sukkerændring kan være en meget vigtig indikation på sygdomstilstand, "Tao sagde." Et panel af proteiner, der er modificeret af sukker, kan være en indikation på en bestemt sygdom. "

Tao sagde, at test viste, at hans metode er 17 til 25 gange mere tilbøjelig til at identificere proteiner, der ellers kunne have været savnet i regelmæssige testprocedurer. Han var også i stand til at identificere glykoproteiner forbundet med blærekræft i en urinprøve.

"Det er muligt at bruge vores platform til at identificere disse sukkermodificerede proteiner som en biomarkør for blærekræft, "Sagde Tao.

Tao vil arbejde for at kommercialisere sit nanopolymer-modificerede proteinarray gennem sit firma, Tymora Analytical Operations, som opererer i Purdue University Research Park. Virksomheden fremstiller pIMAGO nanopolymer, som kan bruges til at afgøre, om kræftlægemidler har været effektive mod biokemiske processer, der kan føre til kræftcelledannelse, og polyMAC, en nanopolymer, der hjælper forskere med at hente og studere proteiner, der gennemgår processer relateret til kræftcelledannelse.