Sumatran næsehorn kom sig aldrig efter tab under Pleistocæn, genom bevis viser

Sumatran næsehornet ( Dicerorhinus sumatrensis ) er et af de mest truede pattedyr på jorden. I 2011 kun omkring 200 af næsehornene mente man fortsat levede i naturen. Nu, et internationalt team af forskere har sekventeret og analyseret det første Sumatran-næsehornsgenom fra en prøve, der tilhører en han, der er blevet berømt i Cincinnati Zoo. Denne undersøgelse rapporterede i Aktuel biologi den 14. december viser, at problemerne for Sumatrans næsehornsbestande begyndte for længe siden, omkring midten af ​​Pleistocæn, omkring en million år siden.

Den nye indsigt i næsehornets demografiske historie er nyttig til at placere artens nuværende bestandsstatus i en bredere økologisk og evolutionær kontekst, siger forskerne.

"Vores genomsekvensdata afslørede, at Pleistocæn var en rutsjetur for Sumatran-næsehornspopulationer, siger Herman Mays, Jr., fra Marshall University.

"Denne art har været godt på vej til at uddø i meget lang tid, " tilføjer Terri Roth ved Center for Conservation and Research of Endangered Wildlife i Cincinnati Zoo and Botanical Garden.

Sumatran-næsehornets befolkning toppede på et tidspunkt, hvor fossile beviser viser en invasion af kontinentale pattedyr i Sundaland (en biogeografisk region i det sydøstlige Asien), omkring 900, 000 år siden, ifølge forskerne. Omkring 12, For 000 år siden - slutningen af ​​Pleistocæn - havde mange store pattedyr lidt, og Sumatran næsehorn var ingen undtagelse.

Stigende havniveauer nedsænkede Sundaland-korridoren, og landbroer, der forbinder øerne Borneo, Java, og Sumatra til den malaysiske halvø og fastlandet Asien forsvandt i havet. Mest sandsynligt som et resultat, siger forskerne, bestanden af ​​næsehorn krympede, da egnede levesteder blev mere og mere fragmenteret. Siden den gang, Sumatran næsehorns bestande er kun faldet yderligere på grund af stigende pres relateret til tab af levesteder og jagt.

"Deres befolkning nåede bunden og viste aldrig tegn på bedring, " siger Mays.

Forskerne kom til disse konklusioner ved at bruge en tilgang kaldet parvis sekventiel Markovian coalescent (PSMC). PSMC gør det muligt at belyse populationshistorien for en art ud fra genomsekvensen af ​​et enkelt individ, hvilket er særligt vigtigt for at studere sjældne eller uddøde arter. Holdet kombinerede PSMC med økologisk nichemodellering for at forstå, hvordan ændringer i befolkningsstørrelse var relateret til klimaændringer i fortiden.

Forskerne vurderer, at Sumatran-næsehornsbestanden toppede med en estimeret effektiv populationsstørrelse på cirka 57, 800 personer omkring 950, 000 år siden. (Effektiv populationsstørrelse er størrelsen af ​​en population, der stemmer overens med den genetiske diversitet i denne population. Den giver et estimat over antallet af reproducerende individer, der bidrager til en population.) Med 9, 000 år siden, genom-beviset tyder på, den effektive bestandsstørrelse blev reduceret til kun omkring 700 Sumatran-næsehorn. Resultaterne tyder på, at klimaændringer i en fjern fortid reducerede den genetiske mangfoldighed af Sumatran-næsehorn, efterlader dem endnu mere sårbare over for senere pres fra menneskelig aktivitet.

DNA-prøven, som Mays og hans team sekventerede, tilhørte et næsehorn ved navn Ipuh, efter lokaliteten på øen Sumatra, hvor han oprindeligt blev samlet. Ipuh boede i Cincinnati Zoo i 22 år indtil sin død i 2013, og hans rester er stadig udstillet på Cincinnati Museum Center. Roth rapporterer, at to af Ipuhs sønner fortsat bor i Sumatran Rhino Sanctuary på Sumatra. En af dem har allerede avlet to kalve.

"Sumatran næsehornsarten hænger i en tråd, " siger Roth. "Vi er nødt til at gøre mere for at redde det."