EAR-proteiner spiller en afgørende rolle i reguleringen af genekspression ved at interagere med andre transkriptionsfaktorer og co-faktorer for at modulere aktiviteten af downstream-målgener. I forbindelse med udvikling af rod og skud fungerer EAR-proteiner som nøglekomponenter i signalveje, der reagerer på forskellige interne og eksterne signaler, såsom hormonniveauer, tilgængelighed af næringsstoffer og lyssignaler.
Et velundersøgt EAR-protein involveret i rod- og skududvikling er EAR1. EAR1 fungerer som en negativ regulator af rodudvikling ved at undertrykke ekspressionen af gener, der fremmer rodvækst og -differentiering. Ved at hæmme rodudviklingen giver EAR1 planten mulighed for at allokere flere ressourcer til skudvækst, hvilket er afgørende under tidlig kimplantetablering og vegetativ vækst.
EAR1 udøver sine regulatoriske virkninger ved at interagere med andre transkriptionsfaktorer, såsom AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF) familien, som spiller en central rolle i forskellige udviklingsprocesser, herunder rod- og skudvækst. EAR1 kan binde til ARF-proteiner og forhindre deres interaktion med DNA og derved hæmme ekspressionen af ARF-målgener involveret i rodudvikling.
På den anden side kan EAR1 også reguleres af miljøsignaler. For eksempel kan høje niveauer af auxin, et plantehormon involveret i rodudvikling, undertrykke ekspressionen af EAR1. Denne negative feedback-løkke sikrer, at rodvækst er stramt kontrolleret som reaktion på auxin-signalering.
Sammenfattende spiller EAR-familien af transkriptionsfaktorer, især EAR1, en afgørende rolle i beslutningsprocessen mellem rod- og skududvikling i planter. Ved at integrere forskellige interne og eksterne signaler finjusterer EAR-proteiner genekspression for at balancere rod- og skudvækst, hvilket i sidste ende former plantens arkitektur og tilpasning til dens miljø.