Saturns atmosfære opvarmes også af Solen, men det påvirker kun de øverste lag af atmosfæren. De nederste lag opvarmes af planetens indre varme, hvorfor temperaturen i atmosfæren stiger, når man bevæger sig tættere på planetens overflade.
Saturns varme indre driver også planetens kraftige vinde. Disse vinde kan nå hastigheder på op til 1.800 kilometer i timen og er ansvarlige for planetens karakteristiske båndede udseende.