Den internationale Human Cell Atlas udgiver strategisk plan, annoncerer data fra den første million celler

Human Cell Atlas (HCA) Consortium har udgivet en plan for det internationale initiativs bestræbelser på at skabe et omfattende referencekort over alle menneskelige celler, et projekt, der skal danne grundlag for en dybere forståelse af menneskers sundhed og for diagnosticering af, overvågning, og behandling af sygdom.

Planens udgivelse - udgivet som en hvidbog til HCA-webstedet - falder sammen med offentliggørelsen af ​​en Naturkommentar fra HCAs organisationskomité, der opsummerer konsortiets vision og mission.

Ud over, konsortiet annoncerede i dag også den forestående frigivelse af genekspressionsprofiler fra de første en million immunceller indsamlet under HCA, mod en indledende milepæl med at indsamle mindst 30 millioner celler, der repræsenterer adskillige væv og organer til atlassets første udkast. Disse data, skal offentliggøres på et online-lager i begyndelsen af ​​november, vil være frit tilgængelig til forskernes brug.

Planen og datafrigivelsen blev præsenteret på den anden HCA-generalforsamling, vært ved Weizmann Institute of Science i Rehovot, Israel. Mødet fejrer konsortiets et-års jubilæum og markerer dets officielle overgang fra planlægning til driftsfase.

"I løbet af det seneste år, det internationale videnskabelige samfund, fra læger til dataloger, har engageret sig i en åben proces for at planlægge, hvordan man skal gøre dette revolutionære atlas, " sagde Aviv Regev, et kernemedlem, formand for fakultetet, og direktør for Klarman Cell Observatory and Cell Circuits Program ved Broad Institute of MIT og Harvard; en HHMI-efterforsker; professor i biologi ved Massachusetts Institute of Technology; og bisidder, med Sarah Teichmann fra Wellcome Trust Sanger Institute, af HCAs organisationskomité. "Sammen, vi har tegnet tegningen. Nu er det tid til at begynde at bygge huset."

"De data, der vil blive indsamlet til atlasset, når færdig, vil give et indgangspunkt for dybere undersøgelse af cellernes funktioner og interaktioner, både i deres hjemmevæv og mere bredt i hele kroppen, sagde Teichmann, leder af cellulær genetik ved Sanger Institute, en forskningsdirektør i fysikafdelingen ved University of Cambridge, og seniorforsker ved Churchill College, Cambridge. "Sådan viden vil over tid, have en transformativ effekt på den videnskabelige forståelse af menneskelig biologi og på menneskers sundhed."

Global strategisk plan

HCA blev lanceret i 2016 med et så ambitiøst mål som Human Genome Project:at skabe et referencekatalog over alle menneskelige celler, deres proportioner, deres placeringer, og samspillet mellem dem. Hvidbogen siger, at for det første udkast til atlasset, konsortiet vil studere og kortlægge mellem 30 og 100 millioner celler fra udvalgte organer og væv, ved hjælp af massivt-parallel enkeltcellet RNA-sekventering (en række genomiske teknikker, der er i stand til at identificere genekspressionsprofiler i tusindvis af individuelle celler ad gangen) relaterede teknologier til at karakterisere andre molekyler, og rumlige metoder til at kortlægge cellers placering og interaktioner.

Konsortiets langsigtede mål er at profilere mindst 10 milliarder celler, der dækker alle væv, organer, og systemer, repræsenterer sunde væv såvel som dem, der er ramt af særlige sygdomme og tilstande. Det fulde atlas vil være så forskelligartet som muligt, indfange en række sygdomme, geografiske placeringer, miljøer, og aldersgrupper.

Governance

Ud over at sætte målene og omfanget af atlassets første udkast, hvidbogen skitserer konsortiets organisations- og ledelsesstrukturer, med stor vægt på videnskabelig mangfoldighed og rummelighed. Det giver også et sæt vejledende principper baseret på etik, egenkapital, og åbenhed, afspejler konsortiets videnskabelige græsrodsoprindelse.

HCA styres og styres af en organisationskomité (OC), HCAs besluttende organ. OC omfatter 27 videnskabsmænd fra 10 lande og ledes i øjeblikket af Aviv Regev (Broad Institute) og Sarah Teichmann (Wellcome Trust Sanger Institute). Se hele listen over HCA-ledelse her.

"HCA blev udtænkt og initieret af forskere, og det bliver styret og drevet af forskere fra 19 institutioner i 10 lande, " sagde Piero Carninci, direktør for afdelingen for genomiske teknologier på RIKEN (Institutet for Fysisk og Kemisk Forskning) i Japan og vicedirektør for RIKEN Center for Life Science Technologies. "Allerede snesevis af videnskabsmænd fra hele verden, herunder forskellige asiatiske lande, har udtrykt deres interesse for at deltage i og bidrage med deres ekspertise til HCA-studier."

Data fra de første en million celler, og vejen til ti mia

De immuncelleekspressionsdata, der annonceres i dag, vil være tilgængelige i en offentlig onlineressource i begyndelsen af ​​november, og omfatter enkeltcellede RNA-ekspressionsprofiler af cirka en million celler indsamlet fra knoglemarv og navlestrengsblod fra raske humane donorer.

Disse udtryksdata vil være frit tilgængelige, give medlemmer af det videnskabelige samfund mulighed for at bruge informationen i forskning. En forpligtelse til åben adgang er en af ​​kerneværdierne i HCA, sammen med centrale etiske overvejelser.

Human Cell Atlas (HCA) er et internationalt samarbejdskonsortium, som har til formål at skabe omfattende referencekort over alle menneskelige celler - livets grundlæggende enheder - som grundlag for både forståelse af menneskers sundhed og diagnosticering, overvågning, og behandling af sygdom. HCA er en grundlæggende, åbne ressourcediagramceller, væv, organer og systemer i hele kroppen. HCA vil påvirke alle aspekter af biologi og medicin, driver translationelle opdagelser og anvendelser og fører i sidste ende til en ny æra inden for præcisionsmedicin.