Videnskab
 Science >> Videnskab >  >> Biologi

Moderne planteenzym partnere med overraskende gammelt protein

Biologer ved Brookhaven Lab producerede disse konfokale mikroskopibilleder på Center for Functional Nanomaterials. Forskerne mærkede CB5D og CB5D-lignende proteiner med et gult fluorescerende protein for at visualisere deres fordelinger i planteceller. Billederne hjalp forskerne med at bekræfte, at det CB5D-lignende protein fra en gammel leverurt-art (til højre) var lokaliseret i de samme subcellulære strukturer som det moderne CB5D-protein (til venstre). Kredit:Brookhaven National Laboratory

Forskere fra det amerikanske energiministeriums (DOE) Brookhaven National Laboratory har opdaget, at et protein, der er ansvarlig for syntesen af ​​et nøgleplantemateriale, udviklede sig meget tidligere end antaget. Forskningen offentliggjort i The Plant Cell , udforsker oprindelsen og udviklingen af ​​det biokemiske maskineri, der bygger lignin, en strukturel komponent i plantecellevægge med betydelig indvirkning på den rene energiindustri.



Da de første landplanter dukkede op fra vandmiljøer, var de nødt til at tilpasse sig for at overleve.

Chang-Jun Liu, en seniorforsker i Brookhavens Biologiske Afdeling, sagde:"Fremkomsten af ​​lignin, som giver strukturel støtte til planterne, var en vigtig evolutionær begivenhed, der muliggjorde planteoverlevelse i det nye terrestriske miljø."

At forstå, hvordan planter udviklede beskyttelsesmekanismer, der muliggør overlevelse i nye miljøer, er afgørende, da de står over for udfordringer pålagt af klimaændringer i dag. Men lignin er også af stor interesse for forskere, der søger efter muligheder for ren energi.

Dette hårde plantemateriale kan forarbejdes og omdannes til værdifulde bioprodukter. Og lignin er den eneste vedvarende kilde til aromatiske forbindelser, som kemisk ligner molekyler, der findes i konventionelt jetbrændstof og kan bruges som "drop-in" brændstof af flyselskaber.

"Moderne planter indeholder tre typer lignin, men de fleste tidlige ligninholdige planter havde kun to typer. Den 'nyere' lignin kaldes syringyl-lignin eller S-lignin," forklarede Liu. S-lignin udviklede sig relativt for nylig med blomstrende planter og er strukturelt mindre kompleks end de andre ligninkomponenter. Dets potentielle industrielle anvendelser har især fanget videnskabsmænds opmærksomhed, fordi S-lignin er relativt let at nedbryde til simple aromater.

Den nye undersøgelse bygger på mange års forskning med fokus på lignin og de molekyler, der er ansvarlige for dets syntese. I 2019 opdagede Liu og hans kolleger, at et specifikt cytochrom b5-protein, CB5D, er uundværligt for produktionen af ​​S-lignin, men ikke de andre, mere ældgamle typer af lignin.

"Det unikke ved CB5Ds rolle i S-ligninsyntese fascinerede os," bemærkede Liu. "Så vi blev inspireret til yderligere at udforske dens oprindelse og udvikling."

Enzymatisk teamwork

I en tidligere undersøgelse fandt Lius team ud af, at CB5D har et særligt partnerskab med et enzym kaldet ferulat 5-hydroxylase (F5H). Sammen syntetiserede disse molekyler det værdifulde S-lignin.

Forskerne vidste, at udviklingen af ​​F5H i blomstrende planter havde ført til produktionen af ​​S-lignin. Så de forventede at finde ud af, at CB5D havde udviklet sig sammen med F5H.

Plantebiologer udtrykte gener fra forskellige plantearter, lige fra evolutionært gamle til evolutionært nyere, i moderne Arabidopsis-planter. Forskerne dyrkede de genetisk ændrede plantekimplanter i petriskåle (til venstre), før de blev overført til jorden (til højre). Kredit:Kevin Coughlin/Brookhaven National Laboratory

For at udforske deres hypotese kørte forskerne en genetisk analyse for at finde andre plantearter, hvis DNA indeholdt gener, der ligner det moderne CB5D-gen, der fungerer som instruktioner til at samle CB5D-proteinet. De identificerede 21 arter, lige fra evolutionært gamle til evolutionært nyere. Forskerne syntetiserede derefter disse gener og udtrykte dem individuelt i en moderne planteart, der var genetisk ændret til at mangle CB5D-genet.

"Uden CB5D-genet syntetiserer planten kun en lille mængde S-lignin," sagde Xianhai Zhao, en postdoc-forsker ved Brookhaven og hovedforfatter på det nye papir. "Men hvis denne funktion blev genoprettet med ekspressionen af ​​et af de relaterede gener, ville vi vide, at genet fungerer på samme måde som det moderne CB5D-gen."

Forskerne opdagede, at et gen fra en grøn algeart, der udviklede sig til en tidlig landplante for over 500 millioner år siden, genoprettede S-ligninsyntesen i den moderne plante. Dette indikerede, at genet udviste CB5D-type funktionalitet. Forskerne fandt også ud af, at funktionen blev bevaret i flere tidlige landplanter, såsom leverurter og mosser.

"Det betyder, at CB5D udviklede sig millioner af år tidligere, end vi havde forventet," forklarede Liu. "Det var ret overraskende at opdage, at en moderne elektronacceptor som F5H havde samarbejdet med et gammelt protein for at udvikle nyt biokemisk maskineri, der syntetiserer den avancerede ligninstruktur."

Videnskabeligt teamwork og næste skridt

CB5D-genet og dets mere gamle modstykke indeholdt lignende DNA-sekvenser og funktioner. Men forskerne ønskede at sikre sig, at CB5D-proteinet fra en gammel art, som leverurt, blev udtrykt i de samme subcellulære strukturer som moderne CB5D.

Så de brugte konfokal mikroskopi på Center for Functional Nanomaterials, en DOE Office of Science brugerfacilitet på Brookhaven Lab, for at bekræfte, at dette var tilfældet.

Efter at have fundet ældgamle gener, der koder for proteiner, der ligner det moderne CB5D-protein med hensyn til S-ligninsyntese i moderne planter og cellulær lokalisering, ønskede teamet at lære mere om dette proteins ældgamle funktion, og hvordan det ændrede sig eller udvidede sig over tid.

Deres analyse viste, at det CB5D-lignende protein dukkede op i akvatiske alger lige før de overgik til et terrestrisk miljø. Og fordi det blev konserveret i tidlige landplanter, tjener dette protein sandsynligvis en eller flere væsentlige funktioner.

"Gamle planter som leverurt indeholdt ikke S-lignin," sagde Zhao. "Hvis proteinet af CB5D-typen ikke var ansvarlig for at syntetisere S-lignin, hvad gjorde det så?"

Liu bemærkede:"Det er det smukke ved forskning. At besvare ét spørgsmål fører dig til endnu mere interessante spørgsmål, der venter på at blive udforsket."

Flere oplysninger: Xianhai Zhao et al., Cytochrom b5-diversitet i grønne linjer gik forud for udviklingen af ​​syringylligninbiosyntese, Plantecellen (2024). DOI:10.1093/plcell/koae120

Journaloplysninger: Plantecelle

Leveret af Brookhaven National Laboratory




Varme artikler