Forskellen i den genomiske DNA-ekstraktion mellem dyr og planter

Strukturen af dobbeltstrenget DNA er universal i alle levende celler, men der forekommer forskelle i metoderne til ekstraktion af genomisk DNA fra dyre- og planteceller. Selvom genomisk DNA lever i cellens kerne, afhænger mængden og renheden af ekstraheret DNA af cellens type og størrelse. For eksempel indeholder visse celler mere DNA og urenheder end andre. Læs videre for at lære mere om forskelle i DNA-ekstraktion.
Generel DNA-ekstraktion

Hvis du behandler plante- og dyreceller med et sæbevand, vil det nedbryde lipiderne i cellen og kernemembranerne. Derefter vil DNA-blandingen adskille sig fra cellemembranerne og proteinerne. Dernæst kan du bruge alkohol til at udfælde DNA'et i opløsningen. Afhængigt af mængden i prøven kan DNA være synligt med det blotte øje. Husk dog, at denne enkle procedure ikke nødvendigvis producerer DNA med høj renhed.
Plante- og dyreceller

Planteceller adskiller sig fra dyreceller på grund af deres stive cellevæg og organeller som chloroplast. De indeholder også proteiner og enzymer, der spiller en rolle i fotosyntesen. Nogle planteceller har polyploidi, hvilket betyder, at de har mere end en kopi af hvert kromosom pr. Celle. Derudover producerer cellulære processer, der forekommer i planter, såsom fotosyntese, en række sekundære metabolitter. Dyreceller har ikke en cellevæg, men har stadig brug for kemikalier som natriumdodecylsulfat (SDS) for at forstyrre cellemembranen for at frigive genomisk DNA.
Plante-DNA-ekstraktion

Plante-genomisk DNA er vanskeligere at udvinde på grund af plantens cellevæg. Du kan fjerne det ved homogenisering eller ved at tilføje cellulase for at nedbryde den cellulose, der udgør cellevæggen. Derudover kan metabolitterne, der findes i plantecellen, forstyrre genomisk DNA-ekstraktion ved at kontaminere DNA-prøven under udfældningsprocessen.
Dyrets DNA-ekstraktion

Perifere blodleukocytter er den vigtigste kilde til animalsk genomisk DNA, men prøveudtagning er vanskelig, fordi blodet skal komme direkte fra dyret. Blod indeholder en række forbindelser som proteiner, lipider, hvide blodlegemer, røde blodlegemer, blodplader og plasma, som kan forurene DNA-prøven. Imidlertid er den primære kontaminant af animalsk DNA ekstraheret fra blodprøver heme, som er den ikke-proteinkomponent i hæmoglobin.
DNA-forskellene

Forskellen mellem plante- og dyre-DNA ligger i sekvensen af baser i helixen. Forbindelser fundet i planteceller er fraværende i dyreceller, og DNA-basesekvenser afspejler dette. Det genomiske plante-DNA er også ofte større end animalsk DNA. Disse forskelle påvirker også ekstraktionsmetoder, udbytte og renheden af DNA.