Bakteriofager (fager) er vira, der inficerer og replikerer i bakterier. Fager er rigelige i miljøet og spiller en afgørende rolle i reguleringen af bakteriepopulationer. Bakterier har udviklet forskellige forsvarsmekanismer for at beskytte sig selv mod faginfektion. En for nylig opdaget forsvarsmekanisme involverer brugen af CRISPR-Cas-systemer.
2. CRISPR-Cas-systemer
CRISPR-Cas-systemer er adaptive immunsystemer, der findes i bakterier og archaea. Disse systemer giver beskyttelse mod faginfektion ved at målrette og ødelægge fremmede nukleinsyrer. CRISPR-Cas-systemer består af to hovedkomponenter:CRISPR-arrays og Cas-proteiner.
- CRISPR-arrays indeholde korte, gentagne sekvenser indskudt med unikke spacer-sekvenser. Disse spacer-sekvenser er afledt af tidligere faginfektioner og tjener som en registrering af tidligere møder med fager.
- Cas-proteiner er ansvarlige for at genkende og spalte fremmede nukleinsyrer. Når en fag inficerer en bakterie, bruger Cas-proteinerne spacer-sekvenserne i CRISPR-arrayet til at guide dem til fagens DNA. Cas-proteinerne spalter derefter fagens DNA, hvilket forhindrer fagen i at replikere og sprede sig.
3. Udvikling af fagresistens
Udviklingen af fagresistens gennem CRISPR-Cas-systemer involverer følgende trin:
1. Initial infektion: En fag inficerer bakterien og begynder at replikere.
2. CRISPR-tilpasning: Bakterien genkender og fanger en kort sekvens fra fagens DNA. Denne sekvens er integreret i CRISPR-arrayet som en ny spacer.
3. Cas-proteinekspression: Ved efterfølgende infektion af en fag med lignende DNA aktiveres CRISPR-Cas-systemet, og Cas-proteiner udtrykkes.
4. Målgenkendelse: Cas-proteinerne bruger spacer-sekvensen i CRISPR-arrayet til at identificere og binde til fagens DNA.
5. DNA-spaltning: Cas-proteinerne spalter fagens DNA på specifikke steder, forstyrrer fagens replikation og forhindrer infektion.
4. Implikationer og betydning
Udviklingen af fagresistens gennem CRISPR-Cas-systemer har betydelige implikationer for fagterapiområdet, som udnytter fager til at kontrollere bakterielle infektioner. CRISPR-Cas-systemer kan begrænse effektiviteten af fagterapi ved at forhindre fager i at inficere og dræbe bakterier. At forstå, hvordan bakterier bruger CRISPR-Cas-systemer, kan hjælpe forskere med at udvikle strategier til at overvinde denne resistens og forbedre effektiviteten af fagterapi.