Der er to hovedtyper af riboswitches:transkriptionelle riboswitches og translationelle riboswitches. Transkriptionelle riboswitches regulerer genekspression ved at kontrollere transkriptionen af downstream-genet. Translationelle riboswitches regulerer genekspression ved at kontrollere translationen af nedstrømsgenet.
I bakterier er riboswitches involveret i en række cellulære processer, herunder metabolisme, transport og virulens. For eksempel regulerer thiaminpyrophosphat (TPP) riboswitchen ekspressionen af gener involveret i thiaminbiosyntese i bakterier. TPP-riboswitchen binder til TPP, hvilket forårsager en konformationsændring, der hæmmer ekspressionen af de nedstrøms gener.
Riboswitches er essentielle for bakteriernes overlevelse og spiller en nøglerolle i reguleringen af genekspression som reaktion på ændringer i miljøet. De er potentielle mål for udviklingen af nye antimikrobielle lægemidler.
Her er en mere detaljeret forklaring på, hvordan molekylære riboswitches virker i bakterier:
Transskriptionelle riboswitches:
1. Riboswitchen er placeret i 5' UTR af mRNA'et.
2. Riboswitchen består af et aptamer-domæne og en ekspressionsplatform.
3. Aptamer-domænet binder til en specifik ligand.
4. Bindingen af liganden forårsager en konformationsændring i riboswitchen.
5. Konformationsændringen i riboswitchen modulerer ekspressionen af nedstrømsgenet.
Oversættelsesriboswitches:
1. Riboswitchen er placeret i 5' UTR af mRNA'et.
2. Riboswitchen består af et aptamer-domæne og en ekspressionsplatform.
3. Aptamer-domænet binder til en specifik ligand.
4. Bindingen af liganden forårsager en konformationsændring i riboswitchen.
5. Konformationsændringen i riboswitchen modulerer translationen af nedstrømsgenet.
Riboswitches er essentielle for bakteriernes overlevelse og spiller en nøglerolle i reguleringen af genekspression som reaktion på ændringer i miljøet. De er potentielle mål for udviklingen af nye antimikrobielle lægemidler.