Sådan får du en tRNA-sekvens fra en DNA-sekvens

Processen til produktion af protein fra en DNA - deoxyribonukleinsyre - sekvens inkluderer to hovedtrin: transkription og translation. Under transkription dannes en messenger ribonukleinsyre eller mRNA fra DNA-skabelonen. Dette mRNA kombineres med et ribosomalt RNA, kendt som rRNA, og overfører RNA eller tRNA, kompleks for at oversætte mRNA-koden til en aminosyresekvens, et protein. DNA består af en sekvens af nukleotidbaser. De fire baser er adenin, thymin, guanin og cytosin. Sekvensen, i hvilken disse baser forekommer på en DNA-streng, koder i sidste ende til produktionen af visse proteiner. Efter at cellen har fremstillet proteinerne, kan de bruges strukturelt eller i forskellige metabolske processer.

Opret et mRNA-transkript af DNA-sekvensen. Hver base i DNA matcher en anden base. Billeder af DNA viser det typisk i en dobbelt helix, hvor baserne på den ene streng forbinder via bindinger til de komplementære baser på den modsatte streng. Komplementære baser er: adenin (A) og thymin (T) og cytosin (C) og guanin (G). Så hvis en DNA-streng læser A-C-G-C-T-A, så er den komplementære streng T-G-C-G-A-T. Du kan finde sekvensen for mRNA-transkriptet på samme måde ved at bruge komplementerne til de baser, der er vist i DNA-sekvensen. RNA indeholder imidlertid ikke basthyminet (T); i stedet erstattes denne base med uracil (U). Når du støder på en adenin (A) i DNA-sekvensen, skal du matche den med en uracil (U).


Hvis DNA-sekvensen er AATCGCTTACGA, så er mRNA-sekvensen UUAGCGAAUGCU.


Opret en tRNA-antikodonsekvens fra mRNA-transkriptet. Hvert tRNA har et sæt af tre baser på det kendt som et anti-codon. Antikodonet matcher komplementære baser i mRNA-sekvensen. For at bestemme den overordnede anti-codon-sekvens, der vil matche en streng af mRNA, skal du ganske enkelt videregive RNA-sekvensen; skriv med andre ord komplementære baser. Ved hjælp af den tidligere bemærkede mRNA-sekvens er tRNA-antikodonsekvensen A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A.


Bryd den tRNA-sekvens, du fandt, i tre-basissæt. Fordi antikodoner består af tre baser ad gangen, er en bedre måde at skrive antikodonsekvensen AATCGC -UUACGA AAT-CGC-UUA-CGA.




Tips


1. Du kan finde antikodonsekvensen endnu hurtigere ved blot at skrive DNA-sekvensen ved at bruge U til uracil i stedet for T for thymin. Del derefter sekvensen i de tre basiske antikodoner.
   

   Du kan bruge anti-kodonsekvensen til at matche de proteiner, der er tilføjet af hvert tRNA under translation, og skabe en aminosyresekvens. Bekræft dog, at det aminosyrereferenceskema, du bruger, er til antikodoner (se Ressourcer). Mange aminosyresekventeringsdiagrammer angiver simpelthen de matchende mRNA-kodoner i stedet for tRNA-antikodoner, så du kan springe over trinnet med bestemmelse af anti-codonsekvensen.
   

   Sekvensen af tRNA-molekylet er simpelthen en RNA-transkription af den DNA-sekvens, der blev brugt til at oprette den.