Hvad bestemmer om et specifikt tRNA kan binde til et mRNA?

Antikodonsekvensen af ​​tRNA'et skal være komplementær til kodonsekvensen af ​​mRNA'et. Det betyder, at baserne i antikodonet skal kunne danne hydrogenbindinger med baserne i kodonet. For eksempel ville antikodonet UAC være i stand til at binde til codonet AUG, fordi U'et i antikodonet ville danne hydrogenbindinger med A'et i kodonet, og C'et i antikodonet ville danne hydrogenbindinger med G'et i kodonet.

Ud over antikodonsekvensen spiller den overordnede struktur af tRNA-molekylet også en rolle i at bestemme, om det kan binde til et mRNA. tRNA-molekylet skal kunne foldes til en specifik form, der gør det muligt for antikodonet at blive eksponeret og tilgængeligt for mRNA'et. Denne form bestemmes af interaktionerne mellem de forskellige baser i tRNA-molekylet, samt af interaktionerne mellem tRNA-molekylet og andre proteiner.

Endelig er bindingen af ​​et tRNA-molekyle til et mRNA også påvirket af tilstedeværelsen af ​​andre molekyler, såsom magnesiumioner og GTP. Disse molekyler er med til at stabilisere interaktionen mellem tRNA'et og mRNA'et, og de er også med til at sikre, at det korrekte tRNA-molekyle bindes til mRNA'et.