Celleteorien er et grundlæggende begreb i biologien, der beskriver livets grundlæggende enhed som cellen. Det blev formuleret i midten af det 19. århundrede af forskerne Theodor Schwann, Matthias Schleiden og Rudolf Virchow. Deres arbejde byggede på observationer og opdagelser gjort af tidligere forskere, herunder Robert Hooke.
Zacharias Janssens opfindelse af mikroskopet, selvom det ikke var specifikt knyttet til udviklingen af celleteorien, gav et afgørende værktøj for videnskabsmænd til at foretage detaljerede observationer af celler. Mikroskopet gjorde det muligt for forskere som Hooke og andre at undersøge cellernes struktur og komponenter, hvilket banede vejen for den endelige forståelse af cellebiologi og formuleringen af celleteorien.