1. ciliater: Karakteriseret ved tilstedeværelsen af cilia, korte hårlignende strukturer, der slår rytmisk til bevægelse og fodring. Eksempler inkluderer *paramecium *og *stentor *.
2. flagellater: Besidder Flagella, lange piskelignende strukturer, der driver dem gennem deres miljø. Nogle flagellater er fotosyntetiske, mens andre er parasitære. Eksempler inkluderer * trypanosoma * (forårsager afrikansk sovesyge) og * giardia * (forårsager giardiasis).
3. Amoebas: Karakteristisk for deres fleksible kroppe og anvendelse af pseudopoder (midlertidige udvidelser af cytoplasma) til bevægelse og opsvulmende mad. Eksempler inkluderer * Amoeba Proteus * og * Entamoeba histolytica * (forårsager amøbe dysenteri).
4. sporozoans: Ikke-motile, parasitiske protozoer, der danner sporer på et tidspunkt af deres livscyklus. De har ofte komplekse livscyklusser, der involverer flere værter. Eksempler inkluderer * Plasmodium * (forårsager malaria) og * Toxoplasma gondii * (forårsager toxoplasmosis).