Hvad er kosmider?
Kosmider er hybridvektorer, der kombinerer træk ved plasmider og bakteriofager. De er i det væsentlige plasmider, der bærer en bestemt DNA -sekvens kaldet et "COS" -sted, der er afledt af Lambda -fagen.
Nøglefunktioner:
* Stor kloningskapacitet: Kosmider kan rumme DNA-indsatser på 35-45KB, markant større end kapaciteten af de fleste plasmider (typisk 10-15 kb). Dette muliggør kloning af større gener eller hele genomer.
* Effektiv emballage: "COS" -stedet muliggør emballage af det kosmid DNA i lambda -fagpartikler. Denne proces bruger fagens emballagemaskineri, hvilket muliggør effektiv levering af det rekombinante DNA til bakterieceller.
* valgbare markører: Kosmider har valgbare markører, som antibiotikaresistensgener, hvilket muliggør identifikation af bakterieceller indeholdende det rekombinante kosmid.
Hvordan kosmider fungerer i rekombinant DNA -teknologi:
1. DNA -fragmentindsættelse: Det DNA -fragment, der skal klones, indsættes i den kosmide vektor på et specifikt restriktionssted.
2. Emballage: Det rekombinante kosmid pakkes i lambda -fagpartikler ved hjælp af en specialiseret in vitro -emballageekstrakt.
3. Infektion: De pakkede fagpartikler inficerer bakterieceller og leverer det rekombinante kosmid.
4. replikation og udvælgelse: Den kosmid replikerer inden i bakteriecellen, og den valgbare markør muliggør valg af bakterier, der bærer det rekombinante kosmid.
5. Gendannelse af klonet DNA: Det klonede DNA kan udvindes fra bakteriecellerne til yderligere analyse eller anvendelser.
Ansøgninger:
* genomkortlægning og sekventering: Kosmider er blevet omfattende anvendt i genomkortlægning og sekventeringsprojekter på grund af deres evne til at klone store DNA -fragmenter.
* genbiblioteker: De bruges til at skabe genomiske biblioteker, der indeholder store fragmenter af DNA, der repræsenterer hele genomet af en organisme.
* Funktionel genomik: Kosmider kan bruges til at undersøge funktionen af store gener eller genklynger.
Fordele ved kosmider:
* høj kloningskapacitet: Tillader kloning af store DNA -fragmenter.
* Effektiv emballage og levering: Lambda Phage Packaging System sikrer effektiv levering i bakterieceller.
* valgbare markører: Fremme identifikationen af bakterier indeholdende det rekombinante kosmid.
Begrænsninger:
* stor størrelse: De er større end plasmider, som kan være en ulempe for visse kloningsprocedurer.
* Potentiel ustabilitet: Store indsatser kan undertiden forårsage ustabilitet i kosmidet.
Sammenfattende er kosmider kraftfulde værktøjer i rekombinant DNA -teknologi, hvilket muliggør kloning og manipulation af store DNA -fragmenter, hvilket gør dem vigtige for forskellige anvendelser inden for genomisk forskning, genterapi og bioteknologi.