Cilia er hårlignende strukturer, der projicerer fra overfladen af nogle celler. De er meget mindre end Flagella (en anden type cellulær projektion) og slår i en koordineret, bølge-lignende bevægelse.
Her er nogle eksempler på, hvordan cilia fungerer:
* Bevægelse: I nogle enkeltcellede organismer hjælper cilia med bevægelse gennem væsker.
* Filtrering: I åndedrætssystemet linjer cilia luftvejene og hjælper med at feje slim og snavs ud af lungerne.
* sensorisk opfattelse: Cilia i det indre øre er involveret i høringen.
Mens Flagella også er involveret i bevægelse, er de længere og bevæger sig typisk på en piskelignende måde.