Hvad er tre måder i, at proteinbinding til enhancer af et gen kan arbejde med at regulere udtryk?

1. Rekruttering af transkriptionsfaktorer:

* mekanisme: Enhancer-bundne proteiner kan direkte interagere med og rekruttere andre transkriptionsfaktorer (TFS) til promotorregionen af genet. Disse TF'er binder ofte til specifikke DNA-sekvenser inden for promotoren, hvilket initierer samlingen af transkriptionens præ-initieringskompleks (PIC).

* Eksempel: Proteinet CREB (CAMP -responselementbindende protein) kan binde til et lejrresponselement (CRE) inden for en enhancer. Når de er aktiveret ved signaleringsveje, rekrutterer CREB andre TF'er som CBP (CREB -bindingsprotein) til promotoren, hvilket fører til øget transkription.

2. Chromatin -ombygning:

* mekanisme: Enhancer-bundne proteiner kan rekruttere enzymer, der modificerer strukturen af kromatin, hvilket gør DNA'et mere tilgængeligt for det transkriptionelle maskineri. Dette kan involvere:

* Histonacetylering: Tilsætning af acetylgrupper til histonhaler, løsner grebet af histoner på DNA og fremmer transkription.

* Histonmethylering: Tilsætning af methylgrupper til histonhaler, som enten kan aktivere eller undertrykke transkription afhængigt af den specifikke lysinrest modificeret.

* Eksempel: Proteinet SWI/SNF er et kromatinomdannelseskompleks, der kan rekrutteres til enhancere af specifikke TFS. SWI/SNF ombygger derefter nukleosomerne i promotorregionen, hvilket giver andre TFS og RNA -polymerase adgang til DNA'et og initierer transkription.

3. Looping og nærhed:

* mekanisme: Enhancers kan være placeret langt væk fra de gener, de regulerer, men proteiner, der er bundet til enhancere, kan interagere med proteiner bundet til promotorregionen og danne en løkke i DNA'et. Dette bringer enhanceren i nærheden af promotoren og letter rekrutteringen af TFS og påbegyndelse af transkription.

* Eksempel: Cohesin og CTCF er proteiner, der spiller en rolle i dannelsen af DNA -løkker. CTCF binder til specifikke DNA -sekvenser, mens cohesin fungerer som en bro for at forbinde disse sekvenser, skabe sløjfer og bringe enhancere tættere på deres målgener.

Det er vigtigt at bemærke, at disse mekanismer ofte fungerer sammen, og den specifikke regulering af et bestemt gen kan involvere et komplekst samspil mellem flere proteiner og veje.