Nyt værktøj tackler reproducerbarhedskrisen i videnskaben

Det videnskabelige samfund har kæmpet med problemet med datareproducerbarhed - et nøgletrin i processen, der guider, hvordan de fleste videnskabsmænd skaber viden inden for deres felt.

Ifølge en nylig undersøgelse, mere end 70 procent af forskerne har forsøgt og undladt at gengive en anden videnskabsmands offentliggjorte eksperimenter. Mere end halvdelen formåede endda ikke at reproducere deres egne undersøgelser med succes. Det rejser spørgsmålet:Hvis et eksperiment eller en simulering ikke kan reproduceres, var det vellykket i første omgang?

Forskere fra Institute for Molecular Engineering ved University of Chicago og Argonne National Laboratory sigter mod at hjælpe med at løse dette problem med en ny softwareplatform, der gør det muligt for forskere at dele dataene fra hver af deres publikationer på en søgbar måde. I løbet af de sidste to år har de udviklet et værktøj til at kuratere, opdage og udforske reproducerbare videnskabelige artikler kaldet Qresp, som nu er tilgængelig for offentligheden.

"Vores mål er at fremskynde den videnskabelige proces og reducere den tid, det tager at dele viden mellem forskere, " sagde Giulia Galli, Liew -familiens professor i molekylær teknik. "Ved at gøre data tilgængelige og søgbare, vi håber at gøre det lettere for forskere at reproducere resultater."

Processen med at reproducere videnskabelige resultater er fortsat et komplekst spørgsmål. Udgivne artikler, som er tilgængelige online som PDF -filer, inkluderer ofte ikke nok information om de resulterende data og processer til, at andre kan reproducere resultaterne, og data stilles ofte ikke til rådighed for det videnskabelige samfund.

"Mange papirer indeholder ikke tilstrækkelige detaljer til at kunne gengive dataene, " sagde Marco Govoni, assisterende videnskabsmand ved Argonne og gæsteforsker ved University of Chicago. "Og ofte er størstedelen af ​​data opnået og brugt i papiret slet ikke tilgængelige. For at få disse data, nogle gange er du nødt til at skrive til forfatterne af papiret. Det burde ikke være så svært, og det bør ikke være en ad hoc-proces."

Med Qresp, forskere håber at hjælpe med at afhjælpe nogle af de nuværende vanskeligheder med at gøre data åbne og reproducerbare. Softwaren guider brugerne gennem processen med at organisere og dele deres data, herunder datasæt og diagrammer. Alle felter kan tilpasses, lade forskere kurere deres data på den bedste måde i henhold til det papir, de har skrevet. Platformen er også tilgængelig for alle, der ønsker at udforske data, der deles af andre forskere.

Selvom der har været flere bestræbelser på at håndtere store datasæt, de fleste af disse bestræbelser er afhængige af et centralt lager, mens Qresp er afhængig af en distribueret model. Inden for platformen, forskere uploader ikke data, men hoster i stedet deres egne kurerede data og beslutter, hvad de vil dele. Den vej, Qresp leverer en skalerbar løsning til deling af data, sagde Govoni.

Forskere, der måske ikke ønsker at tage dette ekstra skridt for at dele deres data lige efter offentliggørelsen, bør overveje fordelene ved at organisere og dele data for deres egen gruppe, sagde Galli. Studerende i hendes gruppe kuraterer nu automatisk deres data i Qresp som endnu et skridt i deres videnskabelige forskning. Qresp letter overførsel af information og viden mellem projekter udført af forskellige studerende, og mellem forskere, der bliver, og dem, der forlader gruppen.

"Hele datadelingsprocessen i gruppen er blevet meget mere effektiv, " sagde Galli, som også er professor i kemi og seniorforsker ved Argonne.

Med brugen og adoptionen af ​​Qresp af et bredt fællesskab af forskere, offentliggjorte artikler kan blive meget mere interaktive - en levende grænseflade, hvor ved at klikke på et billede, en forsker kan se datasættet bag resultaterne.

"Vi ønsker at hæve barren for at reproducere videnskabelige resultater, og vi ønsker at gå videre end at udgive PDF'er og til at dele forskning, der er meget mere interaktiv og nyttig, " sagde Govoni.