Dioxiner er meget giftige kemiske forbindelser, der kan have vedvarende sundhedsskadelige virkninger selv ved lave doser. På grund af deres toksicitet og kræftfremkaldende karakter opstod der bekymringer vedrørende deres tilstedeværelse efter afsporingen.
Men ifølge forskellige miljøagenturer, der var involveret i overvågningen af afsporingsstedet, viste omfattende luftprøvetagning og testning ikke forhøjede niveauer af dioxiner eller andre kemikalier, der giver anledning til bekymring nær de omkringliggende berørte områder eller i nærliggende samfund. Den løbende miljøovervågning fortsatte i ugerne efter hændelsen for at opdage eventuelle langsigtede problemer, der opstod som følge af afsporingen.