Den proces, der drives af molekylær energi, er diffusion. Diffusion er nettobevægelsen af molekyler eller partikler fra et område med højere koncentration til et område med lavere koncentration. Det opstår på grund af molekylers tilfældige bevægelse, som er forårsaget af deres termiske energi. Jo højere temperatur, jo hurtigere bevæger molekylerne sig og jo større er diffusionshastigheden.