Forskere opnår de første stabile simuleringer af DNA -krystaller

Siden strukturbiologiens fødsel, Røntgenkrystallografi har været den mest udbredte teknik til at bestemme den tredimensionelle struktur af biomolekyler, de kemiske forbindelser, der findes i levende organismer. I denne henseende kendskab til interaktionerne mellem biomolekylerne med deres krystalmiljø og de molekylære kræfter, der stabiliserer krystallerne, ville tjene til at optimere denne teknik.

En undersøgelse offentliggjort i tidsskriftet Chem og foretaget af forskere ved Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona) er den første til at opnå stabile simuleringer af DNA -krystaller. Denne præstation har givet forskerne mulighed for at forklare betydningen af ​​de kemiske tilsætningsstoffer, der anvendes eksperimentelt for at opnå passende krystallisationsbetingelser og stabile krystaller i laboratoriet.

"Den første til at drage fordel af denne undersøgelse er samfundet af biofysikere og beregningsfysikere/kemikere, som nu har en reference og klare protokoller for at opnå stabile simuleringer af DNA -krystaller, "siger Pablo D. Dans, postdoktor ved IRB Barcelona.

Anført af Modesto Orozco, leder af laboratoriet for molekylær modellering og bioinformatik, undersøgelsen præsenterer den mest detaljerede atombeskrivelse af egenskaberne af DNA -krystaller til dato.

"På lang sigt, simuleringen af ​​flere krystaller opnået under en række eksperimentelle forhold bør give os mulighed for at forudse og forudsige effekten af ​​et givet kemisk additiv, tjener således til at guide krystallografer i deres eksperimenter og reducere omkostningerne og den tid, der er nødvendig for at opnå krystallerne, betydeligt, "siger Modesto Orozco, hvis laboratorium er en international reference inden for bimolekylær beregning og simulering.